Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD28O15084 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ANKRD28O15084 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ANKRD28O15084 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD28O15084 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms