Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNPHO15079 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNPHO15079 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNPHO15079 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNPHO15079 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNPHO15079 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNPHO15079 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNPHO15079 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNPHO15079 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNPHO15079 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNPHO15079 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNPHO15079 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNPHO15079 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNPHO15079 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNPHO15079 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNPHO15079 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNPHO15079 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNPHO15079 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNPHO15079 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNPHO15079 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNPHO15079 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNPHO15079 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNPHO15079 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNPHO15079 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNPHO15079 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNPHO15079 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNPHO15079 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNPHO15079 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNPHO15079 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNPHO15079 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNPHO15079 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNPHO15079 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNPHO15079 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNPHO15079 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNPHO15079 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNPHO15079 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNPHO15079 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNPHO15079 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNPHO15079 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNPHO15079 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNPHO15079 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNPHO15079 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNPHO15079 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNPHO15079 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNPHO15079 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNPHO15079 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNPHO15079 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNPHO15079 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNPHO15079 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNPHO15079 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNPHO15079 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNPHO15079 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNPHO15079 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNPHO15079 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNPHO15079 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNPHO15079 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNPHO15079 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNPHO15079 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNPHO15079 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNPHO15079 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNPHO15079 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNPHO15079 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNPHO15079 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNPHO15079 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNPHO15079 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNPHO15079 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNPHO15079 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNPHO15079 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SNPHO15079 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNPHO15079 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNPHO15079 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNPHO15079 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNPHO15079 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNPHO15079 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNPHO15079 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNPHO15079 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNPHO15079 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNPHO15079 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNPHO15079 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNPHO15079 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNPHO15079 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNPHO15079 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNPHO15079 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNPHO15079 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNPHO15079 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNPHO15079 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNPHO15079 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNPHO15079 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNPHO15079 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNPHO15079 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNPHO15079 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNPHO15079 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNPHO15079 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNPHO15079 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNPHO15079 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNPHO15079 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNPHO15079 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNPHO15079 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNPHO15079 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNPHO15079 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms