Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SETD1AO15047 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SETD1AO15047 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SETD1AO15047 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SETD1AO15047 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
SETD1AO15047 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
SETD1AO15047 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SETD1AO15047 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SETD1AO15047 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SETD1AO15047 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SETD1AO15047 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SETD1AO15047 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
SETD1AO15047 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SETD1AO15047 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
SETD1AO15047 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SETD1AO15047 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SETD1AO15047 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SETD1AO15047 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SETD1AO15047 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SETD1AO15047 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SETD1AO15047 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SETD1AO15047 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SETD1AO15047 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SETD1AO15047 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SETD1AO15047 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SETD1AO15047 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.34
SETD1AO15047 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SETD1AO15047 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SETD1AO15047 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SETD1AO15047 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SETD1AO15047 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SETD1AO15047 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SETD1AO15047 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SETD1AO15047 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SETD1AO15047 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SETD1AO15047 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SETD1AO15047 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SETD1AO15047 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SETD1AO15047 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SETD1AO15047 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
SETD1AO15047 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SETD1AO15047 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SETD1AO15047 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SETD1AO15047 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.5 ms