Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHOX2AO14813 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHOX2AO14813 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHOX2AO14813 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms