Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFXAPO00287 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFXAPO00287 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFXAPO00287 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RFXAPO00287 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFXAPO00287 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFXAPO00287 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFXAPO00287 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFXAPO00287 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFXAPO00287 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFXAPO00287 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RFXAPO00287 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFXAPO00287 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFXAPO00287 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFXAPO00287 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFXAPO00287 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RFXAPO00287 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RFXAPO00287 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFXAPO00287 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RFXAPO00287 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFXAPO00287 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFXAPO00287 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFXAPO00287 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFXAPO00287 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFXAPO00287 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFXAPO00287 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFXAPO00287 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RFXAPO00287 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RFXAPO00287 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFXAPO00287 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFXAPO00287 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFXAPO00287 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFXAPO00287 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RFXAPO00287 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms