Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H3BQF6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H3BQF6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
H3BQF6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H3BQF6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
H3BQF6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H3BQF6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H3BQF6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
H3BQF6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BQF6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BQF6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BQF6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
H3BQF6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
H3BQF6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
H3BQF6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
H3BQF6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
H3BQF6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H3BQF6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H3BQF6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
H3BQF6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H3BQF6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H3BQF6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H3BQF6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
H3BQF6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H3BQF6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H3BQF6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H3BQF6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
H3BQF6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
H3BQF6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H3BQF6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H3BQF6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
H3BQF6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
H3BQF6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
H3BQF6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
H3BQF6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
H3BQF6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
H3BQF6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
H3BQF6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
H3BQF6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
H3BQF6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
H3BQF6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H3BQF6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H3BQF6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H3BQF6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H3BQF6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H3BQF6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H3BQF6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H3BQF6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
H3BQF6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
H3BQF6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H3BQF6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H3BQF6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H3BQF6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H3BQF6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H3BQF6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H3BQF6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H3BQF6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H3BQF6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H3BQF6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H3BQF6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
H3BQF6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H3BQF6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
H3BQF6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H3BQF6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H3BQF6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H3BQF6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
H3BQF6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H3BQF6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H3BQF6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQF6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQF6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQF6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQF6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQF6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQF6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQF6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQF6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQF6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQF6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQF6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQF6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQF6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQF6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQF6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BQF6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BQF6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BQF6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BQF6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H3BQF6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H3BQF6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H3BQF6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BQF6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BQF6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BQF6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BQF6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BQF6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BQF6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BQF6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BQF6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BQF6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms