Protein–RNA interactions for Protein: C9JR72

KBTBD13, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD13C9JR72 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KBTBD13C9JR72 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KBTBD13C9JR72 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KBTBD13C9JR72 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KBTBD13C9JR72 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KBTBD13C9JR72 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KBTBD13C9JR72 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KBTBD13C9JR72 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KBTBD13C9JR72 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KBTBD13C9JR72 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KBTBD13C9JR72 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KBTBD13C9JR72 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KBTBD13C9JR72 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KBTBD13C9JR72 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KBTBD13C9JR72 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KBTBD13C9JR72 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KBTBD13C9JR72 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KBTBD13C9JR72 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KBTBD13C9JR72 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KBTBD13C9JR72 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KBTBD13C9JR72 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KBTBD13C9JR72 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KBTBD13C9JR72 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KBTBD13C9JR72 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KBTBD13C9JR72 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KBTBD13C9JR72 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KBTBD13C9JR72 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KBTBD13C9JR72 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KBTBD13C9JR72 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms