Protein–RNA interactions for Protein: C9J1V9

EEF1E1-BLOC1S5, EEF1E1-BLOC1S5 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms