Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF879B4DU55 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF879B4DU55 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms