Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNCNA6PVL3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KNCNA6PVL3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms