Protein–RNA interactions for Protein: A6NN92

GJE1, Gap junction epsilon-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJE1A6NN92 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJE1A6NN92 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJE1A6NN92 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJE1A6NN92 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJE1A6NN92 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJE1A6NN92 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJE1A6NN92 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJE1A6NN92 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms