Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
RGPD3A6NKT7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
RGPD3A6NKT7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RGPD3A6NKT7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RGPD3A6NKT7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RGPD3A6NKT7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
RGPD3A6NKT7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
RGPD3A6NKT7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RGPD3A6NKT7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RGPD3A6NKT7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RGPD3A6NKT7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RGPD3A6NKT7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RGPD3A6NKT7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RGPD3A6NKT7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RGPD3A6NKT7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RGPD3A6NKT7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RGPD3A6NKT7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RGPD3A6NKT7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RGPD3A6NKT7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
RGPD3A6NKT7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
RGPD3A6NKT7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RGPD3A6NKT7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RGPD3A6NKT7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
RGPD3A6NKT7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
RGPD3A6NKT7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RGPD3A6NKT7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RGPD3A6NKT7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RGPD3A6NKT7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
RGPD3A6NKT7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RGPD3A6NKT7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RGPD3A6NKT7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RGPD3A6NKT7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
RGPD3A6NKT7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RGPD3A6NKT7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RGPD3A6NKT7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RGPD3A6NKT7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RGPD3A6NKT7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RGPD3A6NKT7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RGPD3A6NKT7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
RGPD3A6NKT7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms