Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC10BA6NIK2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC10BA6NIK2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC10BA6NIK2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC10BA6NIK2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC10BA6NIK2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC10BA6NIK2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC10BA6NIK2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC10BA6NIK2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC10BA6NIK2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC10BA6NIK2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC10BA6NIK2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC10BA6NIK2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC10BA6NIK2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC10BA6NIK2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC10BA6NIK2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC10BA6NIK2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC10BA6NIK2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC10BA6NIK2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC10BA6NIK2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC10BA6NIK2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC10BA6NIK2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC10BA6NIK2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC10BA6NIK2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC10BA6NIK2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC10BA6NIK2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC10BA6NIK2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC10BA6NIK2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC10BA6NIK2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC10BA6NIK2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC10BA6NIK2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC10BA6NIK2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC10BA6NIK2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC10BA6NIK2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC10BA6NIK2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC10BA6NIK2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC10BA6NIK2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC10BA6NIK2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC10BA6NIK2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC10BA6NIK2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC10BA6NIK2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
LRRC10BA6NIK2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC10BA6NIK2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC10BA6NIK2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC10BA6NIK2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC10BA6NIK2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC10BA6NIK2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC10BA6NIK2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC10BA6NIK2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC10BA6NIK2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC10BA6NIK2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC10BA6NIK2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC10BA6NIK2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC10BA6NIK2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC10BA6NIK2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC10BA6NIK2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms