Protein–RNA interactions for Protein: A6NGU7

LINC01546, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01546, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01546A6NGU7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01546A6NGU7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01546A6NGU7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01546A6NGU7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01546A6NGU7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01546A6NGU7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01546A6NGU7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01546A6NGU7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01546A6NGU7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms