Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAM187AA6NFU0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms