Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF27A3QJZ7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF27A3QJZ7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF27A3QJZ7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF27A3QJZ7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF27A3QJZ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF27A3QJZ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF27A3QJZ7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF27A3QJZ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF27A3QJZ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF27A3QJZ7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF27A3QJZ7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF27A3QJZ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF27A3QJZ7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF27A3QJZ7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF27A3QJZ7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF27A3QJZ7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF27A3QJZ7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF27A3QJZ7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms