Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A0A0U1RRA0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A0A0U1RRA0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.8 ms