Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY99

TNFSF12-TNFSF13, Protein TNFSF12-TNFSF13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms