RNA–Protein interactions for RNA: YMR084W

YMR084W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR084W, Length 789 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR084WYMR084W DRS1P32892 752 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
YMR084WYMR084W MTC1P47018 478 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
YMR084WYMR084W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
YMR084WYMR084W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
YMR084WYMR084W TFA1P36100 482 aa10.92□□□□□ -0.66
YMR084WYMR084W AVT3P36062 692 aa10.84□□□□□ -0.67
YMR084WYMR084W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
YMR084WYMR084W ISW2Q08773 1120 aa10.27□□□□□ -0.77
YMR084WYMR084W FAP1P53971 965 aa10.06□□□□□ -0.8
YMR084WYMR084W RPG1P38249 964 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
YMR084WYMR084W PRI1P10363 409 aa9.91□□□□□ -0.82
YMR084WYMR084W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
YMR084WYMR084W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
YMR084WYMR084W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
YMR084WYMR084W REB1P21538 810 aa9.79□□□□□ -0.84
YMR084WYMR084W AAD16Q02895 342 aa9.73□□□□□ -0.85
YMR084WYMR084W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
YMR084WYMR084W SPT21P35209 758 aa9.43□□□□□ -0.9
YMR084WYMR084W RIM101P33400 625 aa9.4□□□□□ -0.9
YMR084WYMR084W PTP3P40048 928 aa9.36□□□□□ -0.91
YMR084WYMR084W PRY3P47033 881 aa9.35□□□□□ -0.91
YMR084WYMR084W SSP1P38871 571 aa9.2□□□□□ -0.94
YMR084WYMR084W MRPL32P25348 183 aa9.16□□□□□ -0.94
YMR084WYMR084W DMA1P38823 416 aa9.14□□□□□ -0.95
YMR084WYMR084W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
YMR084WYMR084W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
YMR084WYMR084W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data9.11□□□□□ -0.95not detected
YMR084WYMR084W OXP1P28273 1286 aa9.07□□□□□ -0.96
YMR084WYMR084W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
YMR084WYMR084W YLR271WQ06152 274 aa8.92□□□□□ -0.98
YMR084WYMR084W HOP09932 586 aa8.91□□□□□ -0.98
YMR084WYMR084W RSM7P47150 247 aa8.91□□□□□ -0.98
YMR084WYMR084W TFC8Q12308 588 aa8.9□□□□□ -0.98
YMR084WYMR084W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
YMR084WYMR084W MGA2P40578 1113 aa8.84□□□□□ -0.99
YMR084WYMR084W DCD1P06773 312 aa8.8□□□□□ -1
YMR084WYMR084W CDC27P38042 758 aa8.77□□□□□ -1.01
YMR084WYMR084W BBC1P47068 1157 aa8.73□□□□□ -1.01
YMR084WYMR084W AI2P03876 854 aa8.72□□□□□ -1.01
YMR084WYMR084W CST9Q06032 482 aa8.66□□□□□ -1.02
YMR084WYMR084W BCH2P36122 765 aa8.64□□□□□ -1.03
YMR084WYMR084W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
YMR084WYMR084W YCK3P39962 524 aa8.62□□□□□ -1.03
YMR084WYMR084W EPS1P40557 701 aa8.56□□□□□ -1.04
YMR084WYMR084W LEO1P38439 464 aa8.49□□□□□ -1.05
YMR084WYMR084W SCY1P53009 804 aa8.49□□□□□ -1.05
YMR084WYMR084W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
YMR084WYMR084W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
YMR084WYMR084W MRM1P25270 412 aa8.47□□□□□ -1.05
YMR084WYMR084W BDF1P35817 686 aa8.47□□□□□ -1.05
YMR084WYMR084W YGL015CP33199 130 aa8.42□□□□□ -1.06
YMR084WYMR084W RTG3P38165 486 aa8.41□□□□□ -1.06
YMR084WYMR084W MAP2P38174 421 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
YMR084WYMR084W TAF7Q05021 590 aa8.41□□□□□ -1.06
YMR084WYMR084W LEU3P08638 886 aa8.4□□□□□ -1.06
YMR084WYMR084W RAM2P29703 316 aa8.39□□□□□ -1.07
YMR084WYMR084W SLX5P32828 619 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YMR084WYMR084W SET1P38827 1080 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YMR084WYMR084W IFH1P39520 1085 aa8.35□□□□□ -1.07
YMR084WYMR084W MAK11P20484 414 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
YMR084WYMR084W RCR1P38212 213 aa8.3□□□□□ -1.08
YMR084WYMR084W CKB1P43639 278 aa8.28□□□□□ -1.08
YMR084WYMR084W VPS70P47161 811 aa8.25□□□□□ -1.09
YMR084WYMR084W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
YMR084WYMR084W YPR148CQ06523 435 aa8.23□□□□□ -1.09
YMR084WYMR084W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data8.2□□□□□ -1.1not detected
YMR084WYMR084W VPS29P38759 282 aa8.19□□□□□ -1.1
YMR084WYMR084W RPN1P38764 993 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
YMR084WYMR084W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
YMR084WYMR084W COQ8P27697 501 aa8.16□□□□□ -1.1
YMR084WYMR084W MIF2P35201 549 aa8.15□□□□□ -1.1
YMR084WYMR084W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
YMR084WYMR084W DBP1P24784 617 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
YMR084WYMR084W YOR238WQ08634 303 aa8.11□□□□□ -1.11
YMR084WYMR084W STS1P38637 319 aa8.08□□□□□ -1.12
YMR084WYMR084W YFR006WP43590 535 aa8.08□□□□□ -1.12
YMR084WYMR084W PBS2P08018 668 aa8.07□□□□□ -1.12
YMR084WYMR084W YAP5P40574 245 aa8.06□□□□□ -1.12
YMR084WYMR084W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.05□□□□□ -1.12not detected
YMR084WYMR084W TGL3P40308 642 aa8.05□□□□□ -1.12
YMR084WYMR084W DSF2P38213 736 aa8.03□□□□□ -1.12
YMR084WYMR084W REF2P42073 533 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
YMR084WYMR084W EDS1P38073 919 aa8.01□□□□□ -1.13
YMR084WYMR084W MAM3Q12296 706 aa8□□□□□ -1.13
YMR084WYMR084W PTC3P34221 468 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
YMR084WYMR084W PIB1Q06651 286 aa7.98□□□□□ -1.13
YMR084WYMR084W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
YMR084WYMR084W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
YMR084WYMR084W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
YMR084WYMR084W GTT3P39996 337 aa7.93□□□□□ -1.14
YMR084WYMR084W IES2P40154 320 aa7.93□□□□□ -1.14
YMR084WYMR084W ATH1P48016 1211 aa7.93□□□□□ -1.14
YMR084WYMR084W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
YMR084WYMR084W DMA2P53924 522 aa7.9□□□□□ -1.14
YMR084WYMR084W HGH1P48362 394 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
YMR084WYMR084W COX6P00427 148 aa7.87□□□□□ -1.15
YMR084WYMR084W GUT1P32190 709 aa7.87□□□□□ -1.15
YMR084WYMR084W KIC1P38692 1080 aa7.87□□□□□ -1.15
YMR084WYMR084W KIN1P13185 1064 aa7.86□□□□□ -1.15
YMR084WYMR084W AIM7Q12156 149 aa7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.8 ms