RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636169.1

EFHC1-215, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

Gene EFHC1, Length 4,308 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-215	ENST00000636169	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		9.66	□□□□□ -0.86
EFHC1-215	ENST00000636169	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		8.98	□□□□□ -0.97
EFHC1-215	ENST00000636169	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	8.76	□□□□□ -1.01
EFHC1-215	ENST00000636169	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		8.64	□□□□□ -1.03
EFHC1-215	ENST00000636169	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		8.54	□□□□□ -1.04
EFHC1-215	ENST00000636169	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	8.37	□□□□□ -1.07
EFHC1-215	ENST00000636169	ABCC9	O60706	1549 aa		8.32	□□□□□ -1.08
EFHC1-215	ENST00000636169	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		8.19	□□□□□ -1.1
EFHC1-215	ENST00000636169	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	8.04	□□□□□ -1.12
EFHC1-215	ENST00000636169	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	8.03	□□□□□ -1.12
EFHC1-215	ENST00000636169	SCRIB	Q14160	1630 aa		7.91	□□□□□ -1.14
EFHC1-215	ENST00000636169	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		7.9	□□□□□ -1.14
EFHC1-215	ENST00000636169	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		7.85	□□□□□ -1.15
EFHC1-215	ENST00000636169	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
EFHC1-215	ENST00000636169	NACAD	O15069	1562 aa		7.82	□□□□□ -1.16
EFHC1-215	ENST00000636169	TRIM41	Q8WV44	630 aa		7.78	□□□□□ -1.16
EFHC1-215	ENST00000636169	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFHC1-215	ENST00000636169	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	7.65	□□□□□ -1.18
EFHC1-215	ENST00000636169	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	7.64	□□□□□ -1.19
EFHC1-215	ENST00000636169	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		7.63	□□□□□ -1.19
EFHC1-215	ENST00000636169	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		7.61	□□□□□ -1.19
EFHC1-215	ENST00000636169	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
EFHC1-215	ENST00000636169	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
EFHC1-215	ENST00000636169	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
EFHC1-215	ENST00000636169	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
EFHC1-215	ENST00000636169	APLP2	Q06481	763 aa		7.53	□□□□□ -1.2
EFHC1-215	ENST00000636169	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		7.53	□□□□□ -1.2
EFHC1-215	ENST00000636169	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
EFHC1-215	ENST00000636169	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFHC1-215	ENST00000636169	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
EFHC1-215	ENST00000636169	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
EFHC1-215	ENST00000636169	SLC24A1	O60721	1099 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFHC1-215	ENST00000636169	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-215	ENST00000636169	WIZ	O95785	1651 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-215	ENST00000636169	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFHC1-215	ENST00000636169	SMARCA4	P51532	1647 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-215	ENST00000636169	FBLN2	P98095	1184 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-215	ENST00000636169	SMARCA2	P51531	1590 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-215	ENST00000636169	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFHC1-215	ENST00000636169	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFHC1-215	ENST00000636169	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFHC1-215	ENST00000636169	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFHC1-215	ENST00000636169	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
EFHC1-215	ENST00000636169	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
EFHC1-215	ENST00000636169	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
EFHC1-215	ENST00000636169	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
EFHC1-215	ENST00000636169	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	7.31	□□□□□ -1.24
EFHC1-215	ENST00000636169	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFHC1-215	ENST00000636169	HRC	P23327	699 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFHC1-215	ENST00000636169	P3H3	Q8IVL6	736 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFHC1-215	ENST00000636169	ERCC6	Q03468	1493 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFHC1-215	ENST00000636169	ABCC8	Q09428	1581 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFHC1-215	ENST00000636169	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFHC1-215	ENST00000636169	NCAPD3	P42695	1498 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFHC1-215	ENST00000636169	ITGAE	P38570	1179 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFHC1-215	ENST00000636169	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFHC1-215	ENST00000636169	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFHC1-215	ENST00000636169	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-215	ENST00000636169	ARID3C	A6NKF2	412 aa		7.22	□□□□□ -1.25
EFHC1-215	ENST00000636169	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		7.22	□□□□□ -1.25
EFHC1-215	ENST00000636169	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
EFHC1-215	ENST00000636169	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-215	ENST00000636169	SOGA1	O94964	1423 aa		7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-215	ENST00000636169	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-215	ENST00000636169	KIF27	Q86VH2	1401 aa		7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-215	ENST00000636169	CUX2	O14529	1486 aa		7.17	□□□□□ -1.26
EFHC1-215	ENST00000636169	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		7.16	□□□□□ -1.26
EFHC1-215	ENST00000636169	EEA1	Q15075	1411 aa		7.16	□□□□□ -1.26
EFHC1-215	ENST00000636169	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		7.16	□□□□□ -1.26
EFHC1-215	ENST00000636169	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
EFHC1-215	ENST00000636169	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		7.15	□□□□□ -1.26
EFHC1-215	ENST00000636169	NES	P48681	1621 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFHC1-215	ENST00000636169	HMGXB3	Q12766	1538 aa		7.14	□□□□□ -1.27
EFHC1-215	ENST00000636169	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
EFHC1-215	ENST00000636169	GOLGA3	Q08378	1498 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-215	ENST00000636169	CLIP1	P30622	1438 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFHC1-215	ENST00000636169	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFHC1-215	ENST00000636169	CFTR	P13569	1480 aa		7.1	□□□□□ -1.27
EFHC1-215	ENST00000636169	CEP162	Q5TB80	1403 aa		7.09	□□□□□ -1.27
EFHC1-215	ENST00000636169	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		7.09	□□□□□ -1.28
EFHC1-215	ENST00000636169	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		7.07	□□□□□ -1.28
EFHC1-215	ENST00000636169	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		7.07	□□□□□ -1.28
EFHC1-215	ENST00000636169	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFHC1-215	ENST00000636169	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFHC1-215	ENST00000636169	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
EFHC1-215	ENST00000636169	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
EFHC1-215	ENST00000636169	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
EFHC1-215	ENST00000636169	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	7.03	□□□□□ -1.28
EFHC1-215	ENST00000636169	ADRA2B	P18089	450 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFHC1-215	ENST00000636169	SYNJ1	O43426	1573 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFHC1-215	ENST00000636169	TRIM52	Q96A61	297 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-215	ENST00000636169	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-215	ENST00000636169	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-215	ENST00000636169	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	7	□□□□□ -1.29
EFHC1-215	ENST00000636169	FOXD1	Q16676	465 aa		7	□□□□□ -1.29
EFHC1-215	ENST00000636169	CUX1	P39880	1505 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFHC1-215	ENST00000636169	KCNH8	Q96L42	1107 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFHC1-215	ENST00000636169	TOPBP1	Q92547	1522 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFHC1-215	ENST00000636169	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFHC1-215	ENST00000636169	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		6.99	□□□□□ -1.29

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