RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589232.5

GTF3C2-AS1-206, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 254 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CHIC1Q5VXU3 224 aa13.76□□□□□ -0.21
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 POTEDQ86YR6 584 aa12.94□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FOXD1Q16676 465 aa11.95□□□□□ -0.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MSH5O43196 834 aa11.58□□□□□ -0.56
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NISCHQ9Y2I1 1504 aa10.56□□□□□ -0.72
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PPP6R1Q9UPN7 881 aa10.42□□□□□ -0.74
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ADRA2BP18089 450 aa10.38□□□□□ -0.75
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ABCC9O60706 1549 aa10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PLPPR3Q6T4P5 718 aa9.98□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 POTEHQ6S545 545 aa9.97□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DMRT2Q9Y5R5 561 aa9.9□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DNAJC5BQ9UF47 199 aa9.78□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RNF39Q9H2S5 420 aa9.76□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DCAF8L1A6NGE4 600 aa9.72□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa9.67□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 UNC13AQ9UPW8 1703 aa9.39□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 BICRAQ9NZM4 1560 aa9.2□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NACADO15069 1562 aa9.15□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DCAF8L2P0C7V8 631 aa9.04□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CECR2Q9BXF3 1484 aa9.02□□□□□ -0.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MYO15BQ96JP2 1530 aa8.85□□□□□ -0.99
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SCRIBQ14160 1630 aa8.84□□□□□ -0.99
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.83□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DSG3P32926 999 aa8.82□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa8.78□□□□□ -1
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CAPN15O75808 1086 aa8.75□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.75□□□□□ -1.01
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.69□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa8.68□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CUX2O14529 1486 aa8.68□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa8.64□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TRIM41Q8WV44 630 aa8.61□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ERCC6Q03468 1493 aa8.59□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NESP48681 1621 aa8.57□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.52□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HAX1O00165 279 aa8.45□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ABCB7O75027 752 aa8.45□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SMARCA2P51531 1590 aa8.44□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NCAPD3P42695 1498 aa8.44□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa8.4□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TRHP20396 242 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HMGXB3Q12766 1538 aa8.37□□□□□ -1.07
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SMARCA4P51532 1647 aa8.36□□□□□ -1.07
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.35□□□□□ -1.07
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LHX8Q68G74 356 aa8.34□□□□□ -1.07
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.32□□□□□ -1.08
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.32□□□□□ -1.08
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.32□□□□□ -1.08
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 WDR62O43379 1518 aa8.26□□□□□ -1.09
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.26□□□□□ -1.09
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.24□□□□□ -1.09
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PEG3Q9GZU2 1588 aa8.23□□□□□ -1.09
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.21□□□□□ -1.09
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 OSCARQ8IYS5 282 aa8.2□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MROH2BQ7Z745 1585 aa8.19□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 EVX2Q03828 476 aa8.18□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ARHGEF11O15085 1522 aa8.18□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 APLP2Q06481 763 aa8.17□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.15□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CHD1O14646 1710 aa8.15□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 WIZO95785 1651 aa8.14□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.13□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.1□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ARAP1Q96P48 1450 aa8.09□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.09□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PRDM2Q13029 1718 aa8.09□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 AKT1S1Q96B36 256 aa8.06□□□□□ -1.12
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.01□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CFTRP13569 1480 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GABBR2O75899 941 aa7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms