RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.64■■■■■ 4.74
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TMEM260-216ENST00000557657 SCRIBQ14160 1630 aa35.75■■■■□ 3.31
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TMEM260-216ENST00000557657 CECR2Q9BXF3 1484 aa35■■■■□ 3.19
TMEM260-216ENST00000557657 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.93■■■■□ 3.18
TMEM260-216ENST00000557657 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.8■■■■□ 3.16
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TMEM260-216ENST00000557657 TRIM41Q8WV44 630 aa34.65■■■■□ 3.14
TMEM260-216ENST00000557657 WIZO95785 1651 aa34.59■■■■□ 3.13
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TMEM260-216ENST00000557657 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.89■■■■□ 3.02
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TMEM260-216ENST00000557657 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.33■■■□□ 2.93
TMEM260-216ENST00000557657 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.29■■■□□ 2.92
TMEM260-216ENST00000557657 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.26■■■□□ 2.92
TMEM260-216ENST00000557657 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.19■■■□□ 2.9
TMEM260-216ENST00000557657 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.15■■■□□ 2.9
TMEM260-216ENST00000557657 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.15■■■□□ 2.9
TMEM260-216ENST00000557657 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.15■■■□□ 2.9
TMEM260-216ENST00000557657 CEP162Q5TB80 1403 aa33.09■■■□□ 2.89
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TMEM260-216ENST00000557657 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.97■■■□□ 2.87
TMEM260-216ENST00000557657 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
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TMEM260-216ENST00000557657 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.99■■■□□ 2.71
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TMEM260-216ENST00000557657 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
TMEM260-216ENST00000557657 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.45■■■□□ 2.63
TMEM260-216ENST00000557657 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
TMEM260-216ENST00000557657 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.42■■■□□ 2.62
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TMEM260-216ENST00000557657 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.33■■■□□ 2.61
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