RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555009.5

RPS6KL1-209, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RPS6KL1, Length 2,457 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RPS6KL1-209ENST00000555009 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.44■■■□□ 2.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.98■■■□□ 2.71
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RPS6KL1-209ENST00000555009 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.63■■■□□ 2.65
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RPS6KL1-209ENST00000555009 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.24■■■□□ 2.43
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RPS6KL1-209ENST00000555009 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.11■■■□□ 2.41
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RPS6KL1-209ENST00000555009 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.96■■■□□ 2.39
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RPS6KL1-209ENST00000555009 TRIM41Q8WV44 630 aa29.56■■■□□ 2.32
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RPS6KL1-209ENST00000555009 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.5■■■□□ 2.31
RPS6KL1-209ENST00000555009 SMARCA4P51532 1647 aa29.49■■■□□ 2.31
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RPS6KL1-209ENST00000555009 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
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RPS6KL1-209ENST00000555009 SMARCA2P51531 1590 aa29.13■■■□□ 2.25
RPS6KL1-209ENST00000555009 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.07■■■□□ 2.24
RPS6KL1-209ENST00000555009 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.95■■■□□ 2.23
RPS6KL1-209ENST00000555009 ABCC8Q09428 1581 aa28.94■■■□□ 2.22
RPS6KL1-209ENST00000555009 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.82■■■□□ 2.2
RPS6KL1-209ENST00000555009 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
RPS6KL1-209ENST00000555009 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
RPS6KL1-209ENST00000555009 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
RPS6KL1-209ENST00000555009 SOGA1O94964 1423 aa28.52■■■□□ 2.16
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RPS6KL1-209ENST00000555009 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.43■■■□□ 2.14
RPS6KL1-209ENST00000555009 SYNJ1O43426 1573 aa28.4■■■□□ 2.14
RPS6KL1-209ENST00000555009 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
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RPS6KL1-209ENST00000555009 NCAPD3P42695 1498 aa28.33■■■□□ 2.13
RPS6KL1-209ENST00000555009 HMGXB3Q12766 1538 aa28.32■■■□□ 2.12
RPS6KL1-209ENST00000555009 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.27■■■□□ 2.12
RPS6KL1-209ENST00000555009 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.24■■■□□ 2.11
RPS6KL1-209ENST00000555009 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
RPS6KL1-209ENST00000555009 EEA1Q15075 1411 aa28.23■■■□□ 2.11
RPS6KL1-209ENST00000555009 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
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RPS6KL1-209ENST00000555009 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.95■■■□□ 2.06
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RPS6KL1-209ENST00000555009 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.95■■■□□ 2.06
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RPS6KL1-209ENST00000555009 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.23■■□□□ 1.95
RPS6KL1-209ENST00000555009 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.22■■□□□ 1.95
RPS6KL1-209ENST00000555009 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
RPS6KL1-209ENST00000555009 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.22■■□□□ 1.95
RPS6KL1-209ENST00000555009 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
RPS6KL1-209ENST00000555009 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
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