RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533903.1

ZBED5-208, Transcript of zinc finger BED-type containing 5, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ZBED5, Length 3,214 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5-208ENST00000533903 NISCHQ9Y2I1 1504 aa15.28■□□□□ 0.04
ZBED5-208ENST00000533903 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa13.56□□□□□ -0.24
ZBED5-208ENST00000533903 SLC24A1O60721 1099 aa13.07□□□□□ -0.32
ZBED5-208ENST00000533903 ABCC9O60706 1549 aa12.92□□□□□ -0.34
ZBED5-208ENST00000533903 CHIC1Q5VXU3 224 aa12.83□□□□□ -0.36
ZBED5-208ENST00000533903 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
ZBED5-208ENST00000533903 MYO15BQ96JP2 1530 aa12.78□□□□□ -0.36
ZBED5-208ENST00000533903 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa12.76□□□□□ -0.37
ZBED5-208ENST00000533903 NACADO15069 1562 aa12.72□□□□□ -0.37
ZBED5-208ENST00000533903 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa12.66□□□□□ -0.38
ZBED5-208ENST00000533903 DCAF8L2P0C7V8 631 aa12.57□□□□□ -0.4
ZBED5-208ENST00000533903 EHMT2Q96KQ7 1210 aa12.46□□□□□ -0.41
ZBED5-208ENST00000533903 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
ZBED5-208ENST00000533903 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa12.29□□□□□ -0.44
ZBED5-208ENST00000533903 SCRIBQ14160 1630 aa12.24□□□□□ -0.45
ZBED5-208ENST00000533903 UNC13AQ9UPW8 1703 aa12.23□□□□□ -0.45
ZBED5-208ENST00000533903 BICRAQ9NZM4 1560 aa12.16□□□□□ -0.46
ZBED5-208ENST00000533903 PLPPR3Q6T4P5 718 aa12.1□□□□□ -0.47
ZBED5-208ENST00000533903 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP12.08□□□□□ -0.48
ZBED5-208ENST00000533903 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
ZBED5-208ENST00000533903 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
ZBED5-208ENST00000533903 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
ZBED5-208ENST00000533903 SMARCA4P51532 1647 aa11.8□□□□□ -0.52
ZBED5-208ENST00000533903 CECR2Q9BXF3 1484 aa11.78□□□□□ -0.52
ZBED5-208ENST00000533903 SMARCA2P51531 1590 aa11.76□□□□□ -0.53
ZBED5-208ENST00000533903 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.75□□□□□ -0.53
ZBED5-208ENST00000533903 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
ZBED5-208ENST00000533903 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11.74□□□□□ -0.53
ZBED5-208ENST00000533903 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
ZBED5-208ENST00000533903 NCAPD3P42695 1498 aa11.71□□□□□ -0.53
ZBED5-208ENST00000533903 MROH2BQ7Z745 1585 aa11.71□□□□□ -0.53
ZBED5-208ENST00000533903 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa11.69□□□□□ -0.54
ZBED5-208ENST00000533903 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
ZBED5-208ENST00000533903 HMGXB3Q12766 1538 aa11.68□□□□□ -0.54
ZBED5-208ENST00000533903 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ZBED5-208ENST00000533903 DNAJC5BQ9UF47 199 aa11.61□□□□□ -0.55
ZBED5-208ENST00000533903 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
ZBED5-208ENST00000533903 WIZO95785 1651 aa11.57□□□□□ -0.56
ZBED5-208ENST00000533903 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
ZBED5-208ENST00000533903 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
ZBED5-208ENST00000533903 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
ZBED5-208ENST00000533903 KCNA4P22459 653 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED5-208ENST00000533903 CCDC88BA6NC98 1476 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED5-208ENST00000533903 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED5-208ENST00000533903 CSRNP3Q8WYN3 585 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED5-208ENST00000533903 CADPSQ9ULU8 1353 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED5-208ENST00000533903 CFTRP13569 1480 aa11.33□□□□□ -0.6
ZBED5-208ENST00000533903 PDS5BQ9NTI5 1447 aa11.31□□□□□ -0.6
ZBED5-208ENST00000533903 PRDM2Q13029 1718 aa11.26□□□□□ -0.61
ZBED5-208ENST00000533903 APLP2Q06481 763 aa11.24□□□□□ -0.61
ZBED5-208ENST00000533903 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa11.23□□□□□ -0.61
ZBED5-208ENST00000533903 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
ZBED5-208ENST00000533903 NESP48681 1621 aa11.21□□□□□ -0.61
ZBED5-208ENST00000533903 ERCC6Q03468 1493 aa11.2□□□□□ -0.62
ZBED5-208ENST00000533903 FANCD2Q9BXW9 1451 aa11.2□□□□□ -0.62
ZBED5-208ENST00000533903 CEP164Q9UPV0 1460 aa11.19□□□□□ -0.62
ZBED5-208ENST00000533903 ABCC8Q09428 1581 aa11.18□□□□□ -0.62
ZBED5-208ENST00000533903 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.14□□□□□ -0.63
ZBED5-208ENST00000533903 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa11.11□□□□□ -0.63
ZBED5-208ENST00000533903 CUX2O14529 1486 aa11.09□□□□□ -0.63
ZBED5-208ENST00000533903 WDR62O43379 1518 aa11.09□□□□□ -0.63
ZBED5-208ENST00000533903 DNMBPQ6XZF7 1577 aa11.07□□□□□ -0.64
ZBED5-208ENST00000533903 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
ZBED5-208ENST00000533903 ERICH6Q7L0X2 663 aa11.07□□□□□ -0.64
ZBED5-208ENST00000533903 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
ZBED5-208ENST00000533903 MYT1Q01538 1121 aa11.06□□□□□ -0.64
ZBED5-208ENST00000533903 HRCP23327 699 aa11.05□□□□□ -0.64
ZBED5-208ENST00000533903 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ZBED5-208ENST00000533903 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP11.05□□□□□ -0.64
ZBED5-208ENST00000533903 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
ZBED5-208ENST00000533903 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
ZBED5-208ENST00000533903 TOPBP1Q92547 1522 aa11.03□□□□□ -0.64
ZBED5-208ENST00000533903 TOP2BQ02880 1626 aa11□□□□□ -0.65
ZBED5-208ENST00000533903 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa11□□□□□ -0.65
ZBED5-208ENST00000533903 CUX1P39880 1505 aa10.99□□□□□ -0.65
ZBED5-208ENST00000533903 IFT140Q96RY7 1462 aa10.98□□□□□ -0.65
ZBED5-208ENST00000533903 WDR97A6NE52 1622 aa10.97□□□□□ -0.65
ZBED5-208ENST00000533903 ARXQ96QS3 562 aa10.95□□□□□ -0.66
ZBED5-208ENST00000533903 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
ZBED5-208ENST00000533903 FGD5Q6ZNL6 1462 aa10.94□□□□□ -0.66
ZBED5-208ENST00000533903 SOGA1O94964 1423 aa10.93□□□□□ -0.66
ZBED5-208ENST00000533903 SYNJ1O43426 1573 aa10.93□□□□□ -0.66
ZBED5-208ENST00000533903 KLHL34Q8N239 644 aa10.93□□□□□ -0.66
ZBED5-208ENST00000533903 TRIM41Q8WV44 630 aa10.91□□□□□ -0.66
ZBED5-208ENST00000533903 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.9□□□□□ -0.66
ZBED5-208ENST00000533903 TAOK2Q9UL54 1235 aa10.9□□□□□ -0.67
ZBED5-208ENST00000533903 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
ZBED5-208ENST00000533903 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
ZBED5-208ENST00000533903 EEA1Q15075 1411 aa10.84□□□□□ -0.67
ZBED5-208ENST00000533903 KIF27Q86VH2 1401 aa10.84□□□□□ -0.67
ZBED5-208ENST00000533903 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.84□□□□□ -0.67
ZBED5-208ENST00000533903 TPRNQ4KMQ1 711 aa10.82□□□□□ -0.68
ZBED5-208ENST00000533903 GRIN2BQ13224 1484 aa10.81□□□□□ -0.68
ZBED5-208ENST00000533903 GAPVD1Q14C86 1478 aa10.81□□□□□ -0.68
ZBED5-208ENST00000533903 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa10.8□□□□□ -0.68
ZBED5-208ENST00000533903 ERICH3Q5RHP9 1530 aa10.8□□□□□ -0.68
ZBED5-208ENST00000533903 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
ZBED5-208ENST00000533903 ADRA2BP18089 450 aa10.79□□□□□ -0.68
ZBED5-208ENST00000533903 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
ZBED5-208ENST00000533903 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.2 ms