RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494398.5

CERKL-213, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 2

Gene CERKL, Length 2,391 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-213ENST00000494398 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.01■■■■■ 4.8
CERKL-213ENST00000494398 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.41■■■■□ 3.74
CERKL-213ENST00000494398 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.05■■■■□ 3.68
CERKL-213ENST00000494398 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.67
CERKL-213ENST00000494398 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.38■■■■□ 3.57
CERKL-213ENST00000494398 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
CERKL-213ENST00000494398 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.01■■■■□ 3.51
CERKL-213ENST00000494398 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.1■■■■□ 3.37
CERKL-213ENST00000494398 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.07■■■■□ 3.37
CERKL-213ENST00000494398 SCRIBQ14160 1630 aa35.87■■■■□ 3.33
CERKL-213ENST00000494398 ABCC9O60706 1549 aa35.77■■■■□ 3.32
CERKL-213ENST00000494398 NACADO15069 1562 aa35.63■■■■□ 3.29
CERKL-213ENST00000494398 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
CERKL-213ENST00000494398 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.08■■■■□ 3.21
CERKL-213ENST00000494398 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.06■■■■□ 3.2
CERKL-213ENST00000494398 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.96■■■■□ 3.19
CERKL-213ENST00000494398 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.92■■■■□ 3.18
CERKL-213ENST00000494398 TRIM41Q8WV44 630 aa34.8■■■■□ 3.16
CERKL-213ENST00000494398 WIZO95785 1651 aa34.69■■■■□ 3.14
CERKL-213ENST00000494398 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.66■■■■□ 3.14
CERKL-213ENST00000494398 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
CERKL-213ENST00000494398 HRCP23327 699 aa34.48■■■■□ 3.11
CERKL-213ENST00000494398 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
CERKL-213ENST00000494398 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.39■■■■□ 3.1
CERKL-213ENST00000494398 SMARCA4P51532 1647 aa34.31■■■■□ 3.08
CERKL-213ENST00000494398 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
CERKL-213ENST00000494398 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
CERKL-213ENST00000494398 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.15■■■■□ 3.06
CERKL-213ENST00000494398 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
CERKL-213ENST00000494398 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.07■■■■□ 3.04
CERKL-213ENST00000494398 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.05■■■■□ 3.04
CERKL-213ENST00000494398 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.04■■■■□ 3.04
CERKL-213ENST00000494398 SMARCA2P51531 1590 aa33.99■■■■□ 3.03
CERKL-213ENST00000494398 ABCC8Q09428 1581 aa33.8■■■■□ 3
CERKL-213ENST00000494398 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.72■■■□□ 2.99
CERKL-213ENST00000494398 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
CERKL-213ENST00000494398 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.54■■■□□ 2.96
CERKL-213ENST00000494398 SOGA1O94964 1423 aa33.47■■■□□ 2.95
CERKL-213ENST00000494398 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
CERKL-213ENST00000494398 EEA1Q15075 1411 aa33.39■■■□□ 2.94
CERKL-213ENST00000494398 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.38■■■□□ 2.93
CERKL-213ENST00000494398 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.36■■■□□ 2.93
CERKL-213ENST00000494398 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP33.34■■■□□ 2.93
CERKL-213ENST00000494398 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.28■■■□□ 2.92
CERKL-213ENST00000494398 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.24■■■□□ 2.91
CERKL-213ENST00000494398 CEP162Q5TB80 1403 aa33.22■■■□□ 2.91
CERKL-213ENST00000494398 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.19■■■□□ 2.9
CERKL-213ENST00000494398 SYNJ1O43426 1573 aa33.14■■■□□ 2.9
CERKL-213ENST00000494398 GOLGA3Q08378 1498 aa33.08■■■□□ 2.89
CERKL-213ENST00000494398 NCAPD3P42695 1498 aa32.98■■■□□ 2.87
CERKL-213ENST00000494398 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.94■■■□□ 2.86
CERKL-213ENST00000494398 HMGXB3Q12766 1538 aa32.92■■■□□ 2.86
CERKL-213ENST00000494398 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.88■■■□□ 2.85
CERKL-213ENST00000494398 KIF21BO75037 1637 aa32.85■■■□□ 2.85
CERKL-213ENST00000494398 TOP2BQ02880 1626 aa32.82■■■□□ 2.84
CERKL-213ENST00000494398 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
CERKL-213ENST00000494398 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
CERKL-213ENST00000494398 CLIP1P30622 1438 aa32.69■■■□□ 2.82
CERKL-213ENST00000494398 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.68■■■□□ 2.82
CERKL-213ENST00000494398 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.68■■■□□ 2.82
CERKL-213ENST00000494398 CFTRP13569 1480 aa32.61■■■□□ 2.81
CERKL-213ENST00000494398 CUX1P39880 1505 aa32.54■■■□□ 2.8
CERKL-213ENST00000494398 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.51■■■□□ 2.8
CERKL-213ENST00000494398 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
CERKL-213ENST00000494398 APLP2Q06481 763 aa32.45■■■□□ 2.78
CERKL-213ENST00000494398 PRXQ9BXM0 1461 aa32.45■■■□□ 2.78
CERKL-213ENST00000494398 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.41■■■□□ 2.78
CERKL-213ENST00000494398 KIF27Q86VH2 1401 aa32.41■■■□□ 2.78
CERKL-213ENST00000494398 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.33■■■□□ 2.77
CERKL-213ENST00000494398 PRDM2Q13029 1718 aa32.24■■■□□ 2.75
CERKL-213ENST00000494398 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
CERKL-213ENST00000494398 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.21■■■□□ 2.75
CERKL-213ENST00000494398 ARAP1Q96P48 1450 aa32.14■■■□□ 2.74
CERKL-213ENST00000494398 CUX2O14529 1486 aa32.11■■■□□ 2.73
CERKL-213ENST00000494398 IGF1RP08069 1367 aa32.06■■■□□ 2.72
CERKL-213ENST00000494398 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.03■■■□□ 2.72
CERKL-213ENST00000494398 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.97■■■□□ 2.71
CERKL-213ENST00000494398 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.7
CERKL-213ENST00000494398 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.94■■■□□ 2.7
CERKL-213ENST00000494398 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.93■■■□□ 2.7
CERKL-213ENST00000494398 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
CERKL-213ENST00000494398 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
CERKL-213ENST00000494398 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.77■■■□□ 2.68
CERKL-213ENST00000494398 NESP48681 1621 aa31.76■■■□□ 2.67
CERKL-213ENST00000494398 TOPBP1Q92547 1522 aa31.72■■■□□ 2.67
CERKL-213ENST00000494398 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.71■■■□□ 2.67
CERKL-213ENST00000494398 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
CERKL-213ENST00000494398 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
CERKL-213ENST00000494398 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.68■■■□□ 2.66
CERKL-213ENST00000494398 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.62■■■□□ 2.65
CERKL-213ENST00000494398 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.59■■■□□ 2.65
CERKL-213ENST00000494398 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.58■■■□□ 2.65
CERKL-213ENST00000494398 MAP3K1Q13233 1512 aa31.57■■■□□ 2.64
CERKL-213ENST00000494398 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
CERKL-213ENST00000494398 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.54■■■□□ 2.64
CERKL-213ENST00000494398 P3H3Q8IVL6 736 aa31.53■■■□□ 2.64
CERKL-213ENST00000494398 TIAM1Q13009 1591 aa31.53■■■□□ 2.64
CERKL-213ENST00000494398 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
CERKL-213ENST00000494398 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
CERKL-213ENST00000494398 ITGAEP38570 1179 aa31.48■■■□□ 2.63
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