RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446095.1

RPSAP23-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 23, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP23, Length 883 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP23-201ENST00000446095 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.76■■□□□ 1.07
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RPSAP23-201ENST00000446095 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.01■□□□□ 0.47
RPSAP23-201ENST00000446095 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.69■□□□□ 0.42
RPSAP23-201ENST00000446095 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
RPSAP23-201ENST00000446095 DCAF8L2P0C7V8 631 aa17.56■□□□□ 0.4
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RPSAP23-201ENST00000446095 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.32■□□□□ 0.36
RPSAP23-201ENST00000446095 SCRIBQ14160 1630 aa17.21■□□□□ 0.35
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RPSAP23-201ENST00000446095 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.06■□□□□ 0.32
RPSAP23-201ENST00000446095 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
RPSAP23-201ENST00000446095 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.77■□□□□ 0.27
RPSAP23-201ENST00000446095 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.73■□□□□ 0.27
RPSAP23-201ENST00000446095 HRCP23327 699 aa16.72■□□□□ 0.27
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RPSAP23-201ENST00000446095 SMARCA4P51532 1647 aa16.61■□□□□ 0.25
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RPSAP23-201ENST00000446095 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.59■□□□□ 0.25
RPSAP23-201ENST00000446095 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.56■□□□□ 0.24
RPSAP23-201ENST00000446095 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.55■□□□□ 0.24
RPSAP23-201ENST00000446095 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
RPSAP23-201ENST00000446095 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.44■□□□□ 0.22
RPSAP23-201ENST00000446095 SMARCA2P51531 1590 aa16.43■□□□□ 0.22
RPSAP23-201ENST00000446095 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.38■□□□□ 0.21
RPSAP23-201ENST00000446095 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.36■□□□□ 0.21
RPSAP23-201ENST00000446095 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
RPSAP23-201ENST00000446095 EEA1Q15075 1411 aa16.36■□□□□ 0.21
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RPSAP23-201ENST00000446095 ABCC8Q09428 1581 aa16.18■□□□□ 0.18
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RPSAP23-201ENST00000446095 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.13■□□□□ 0.17
RPSAP23-201ENST00000446095 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RPSAP23-201ENST00000446095 GOLGA3Q08378 1498 aa16.08■□□□□ 0.16
RPSAP23-201ENST00000446095 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
RPSAP23-201ENST00000446095 KIF21BO75037 1637 aa16.05■□□□□ 0.16
RPSAP23-201ENST00000446095 CEP162Q5TB80 1403 aa16.04■□□□□ 0.16
RPSAP23-201ENST00000446095 HMGXB3Q12766 1538 aa16.03■□□□□ 0.16
RPSAP23-201ENST00000446095 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.03■□□□□ 0.16
RPSAP23-201ENST00000446095 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.02■□□□□ 0.16
RPSAP23-201ENST00000446095 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RPSAP23-201ENST00000446095 SOGA1O94964 1423 aa16.01■□□□□ 0.15
RPSAP23-201ENST00000446095 SYNJ1O43426 1573 aa15.97■□□□□ 0.15
RPSAP23-201ENST00000446095 TOP2BQ02880 1626 aa15.94■□□□□ 0.14
RPSAP23-201ENST00000446095 NCAPD3P42695 1498 aa15.93■□□□□ 0.14
RPSAP23-201ENST00000446095 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.93■□□□□ 0.14
RPSAP23-201ENST00000446095 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.89■□□□□ 0.13
RPSAP23-201ENST00000446095 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.86■□□□□ 0.13
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RPSAP23-201ENST00000446095 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.84■□□□□ 0.13
RPSAP23-201ENST00000446095 PRDM2Q13029 1718 aa15.8■□□□□ 0.12
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RPSAP23-201ENST00000446095 CFTRP13569 1480 aa15.75■□□□□ 0.11
RPSAP23-201ENST00000446095 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
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RPSAP23-201ENST00000446095 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.7■□□□□ 0.1
RPSAP23-201ENST00000446095 KIF27Q86VH2 1401 aa15.68■□□□□ 0.1
RPSAP23-201ENST00000446095 CUX1P39880 1505 aa15.66■□□□□ 0.1
RPSAP23-201ENST00000446095 APLP2Q06481 763 aa15.65■□□□□ 0.1
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RPSAP23-201ENST00000446095 ARAP1Q96P48 1450 aa15.52■□□□□ 0.08
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RPSAP23-201ENST00000446095 MAP3K1Q13233 1512 aa15.48■□□□□ 0.07
RPSAP23-201ENST00000446095 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.44■□□□□ 0.06
RPSAP23-201ENST00000446095 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
RPSAP23-201ENST00000446095 CUX2O14529 1486 aa15.43■□□□□ 0.06
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RPSAP23-201ENST00000446095 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.37■□□□□ 0.05
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RPSAP23-201ENST00000446095 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.36■□□□□ 0.05
RPSAP23-201ENST00000446095 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
RPSAP23-201ENST00000446095 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.35■□□□□ 0.05
RPSAP23-201ENST00000446095 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.34■□□□□ 0.05
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RPSAP23-201ENST00000446095 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.33■□□□□ 0.05
RPSAP23-201ENST00000446095 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
RPSAP23-201ENST00000446095 TIAM1Q13009 1591 aa15.32■□□□□ 0.04
RPSAP23-201ENST00000446095 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.3■□□□□ 0.04
RPSAP23-201ENST00000446095 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.29■□□□□ 0.04
RPSAP23-201ENST00000446095 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
RPSAP23-201ENST00000446095 TOPBP1Q92547 1522 aa15.27■□□□□ 0.04
RPSAP23-201ENST00000446095 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.03
RPSAP23-201ENST00000446095 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.25■□□□□ 0.03
RPSAP23-201ENST00000446095 WDR97A6NE52 1622 aa15.25■□□□□ 0.03
RPSAP23-201ENST00000446095 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
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