RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365174.1

RNA5SP223-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 223, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP223, Length 120 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RNA5SP223-201ENST00000365174 ABCC9O60706 1549 aa9.51□□□□□ -0.89
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RNA5SP223-201ENST00000365174 SMARCA2P51531 1590 aa8.76□□□□□ -1.01
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RNA5SP223-201ENST00000365174 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RNA5SP223-201ENST00000365174 HMGXB3Q12766 1538 aa8.65□□□□□ -1.02
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RNA5SP223-201ENST00000365174 NCAPD3P42695 1498 aa8.6□□□□□ -1.03
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RNA5SP223-201ENST00000365174 TRIM41Q8WV44 630 aa8.6□□□□□ -1.03
RNA5SP223-201ENST00000365174 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa8.58□□□□□ -1.04
RNA5SP223-201ENST00000365174 PLPPR3Q6T4P5 718 aa8.56□□□□□ -1.04
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RNA5SP223-201ENST00000365174 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RNA5SP223-201ENST00000365174 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
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RNA5SP223-201ENST00000365174 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.41□□□□□ -1.06
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RNA5SP223-201ENST00000365174 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.35□□□□□ -1.07
RNA5SP223-201ENST00000365174 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.34□□□□□ -1.07
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RNA5SP223-201ENST00000365174 CUX1P39880 1505 aa8.32□□□□□ -1.08
RNA5SP223-201ENST00000365174 SOGA1O94964 1423 aa8.3□□□□□ -1.08
RNA5SP223-201ENST00000365174 NESP48681 1621 aa8.3□□□□□ -1.08
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RNA5SP223-201ENST00000365174 KIF27Q86VH2 1401 aa8.29□□□□□ -1.08
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RNA5SP223-201ENST00000365174 KIF21BO75037 1637 aa8.26□□□□□ -1.09
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RNA5SP223-201ENST00000365174 CUX2O14529 1486 aa8.24□□□□□ -1.09
RNA5SP223-201ENST00000365174 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.24□□□□□ -1.09
RNA5SP223-201ENST00000365174 TOPBP1Q92547 1522 aa8.24□□□□□ -1.09
RNA5SP223-201ENST00000365174 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.22□□□□□ -1.09
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RNA5SP223-201ENST00000365174 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.2□□□□□ -1.1
RNA5SP223-201ENST00000365174 CEP162Q5TB80 1403 aa8.2□□□□□ -1.1
RNA5SP223-201ENST00000365174 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
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RNA5SP223-201ENST00000365174 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.17□□□□□ -1.1
RNA5SP223-201ENST00000365174 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
RNA5SP223-201ENST00000365174 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.16□□□□□ -1.1
RNA5SP223-201ENST00000365174 CUL7Q14999 1698 aa8.15□□□□□ -1.1
RNA5SP223-201ENST00000365174 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.15□□□□□ -1.1
RNA5SP223-201ENST00000365174 PRXQ9BXM0 1461 aa8.14□□□□□ -1.11
RNA5SP223-201ENST00000365174 CLIP1P30622 1438 aa8.14□□□□□ -1.11
RNA5SP223-201ENST00000365174 HOMEZQ8IX15 550 aa8.14□□□□□ -1.11
RNA5SP223-201ENST00000365174 WDR97A6NE52 1622 aa8.14□□□□□ -1.11
RNA5SP223-201ENST00000365174 WDR62O43379 1518 aa8.13□□□□□ -1.11
RNA5SP223-201ENST00000365174 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.12□□□□□ -1.11
RNA5SP223-201ENST00000365174 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.12□□□□□ -1.11
RNA5SP223-201ENST00000365174 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.12□□□□□ -1.11
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