RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.42□□□□□ -2.18
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1128P-201ENST00000362825 XP32Q5T750 250 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.06□□□□□ -2.24
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CRCT1Q9UGL9 99 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MUC5ACP98088 5654 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LOC100996750A0A140TA64 210 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ILDR2Q71H61 639 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP5-2Q701N4 177 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP5-8O75690 187 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP5-9P26371 169 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NEBP20929 6669 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NOTCH1P46531 2555 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KMT2DO14686 5537 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RGS19P49795 217 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OBSCNQ5VST9 7968 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TTC28Q96AY4 2481 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MDN1Q9NU22 5596 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SSPOA2VEC9 5147 aa0.34□□□□□ -2.35
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MUC2Q02817 5179 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT32Q14532 448 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MUC19Q7Z5P9 8384 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBN3Q75N90 2809 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCLOQ9Y6V0 5065 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLSCR2Q9NRY7 297 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGSF5Q9NSI5 407 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MUC12Q9UKN1 5478 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STAB1Q9NY15 2570 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PHGR1C9JFL3 82 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPTBN4Q9H254 2564 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL6A3P12111 3177 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RYR2Q92736 4967 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CAPNS1P04632 268 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LCE1CQ5T751 118 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LCE1EQ5T753 118 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LURAP1LQ8IV03 231 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GSC2O15499 205 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LCE1FQ5T754 118 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT10P13645 584 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RYR1P21817 5038 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ONECUT2O95948 504 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBXL17Q9UF56 701 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNF213Q63HN8 5207 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CAAP1Q9H8G2 361 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UNC79Q9P2D8 2635 aa-0.17□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms