RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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SMARCE1-201ENST00000264640 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1-201ENST00000264640 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
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SMARCE1-201ENST00000264640 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.12■□□□□ 0.17
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCC9O60706 1549 aa16.03■□□□□ 0.16
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SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa15.6■□□□□ 0.09
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SMARCE1-201ENST00000264640 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa15.02■□□□□ -0
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SMARCE1-201ENST00000264640 NACADO15069 1562 aa14.78□□□□□ -0.04
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SMARCE1-201ENST00000264640 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.74□□□□□ -0.05
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SMARCE1-201ENST00000264640 BICRAQ9NZM4 1560 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1-201ENST00000264640 DCAF8L2P0C7V8 631 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-201ENST00000264640 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa14.47□□□□□ -0.09
SMARCE1-201ENST00000264640 CECR2Q9BXF3 1484 aa14.44□□□□□ -0.1
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SMARCE1-201ENST00000264640 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.36□□□□□ -0.11
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SMARCE1-201ENST00000264640 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa14.27□□□□□ -0.12
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.27□□□□□ -0.13
SMARCE1-201ENST00000264640 SCRIBQ14160 1630 aa14.24□□□□□ -0.13
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SMARCE1-201ENST00000264640 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.06□□□□□ -0.16
SMARCE1-201ENST00000264640 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
SMARCE1-201ENST00000264640 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa14.05□□□□□ -0.16
SMARCE1-201ENST00000264640 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.03□□□□□ -0.16
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
SMARCE1-201ENST00000264640 CUX2O14529 1486 aa13.93□□□□□ -0.18
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF39Q9H2S5 420 aa13.92□□□□□ -0.18
SMARCE1-201ENST00000264640 ERCC6Q03468 1493 aa13.85□□□□□ -0.19
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SMARCE1-201ENST00000264640 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
SMARCE1-201ENST00000264640 NESP48681 1621 aa13.66□□□□□ -0.22
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM41Q8WV44 630 aa13.66□□□□□ -0.22
SMARCE1-201ENST00000264640 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SMARCE1-201ENST00000264640 NCAPD3P42695 1498 aa13.61□□□□□ -0.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa13.55□□□□□ -0.24
SMARCE1-201ENST00000264640 SMARCA2P51531 1590 aa13.54□□□□□ -0.24
SMARCE1-201ENST00000264640 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa13.54□□□□□ -0.24
SMARCE1-201ENST00000264640 HMGXB3Q12766 1538 aa13.53□□□□□ -0.24
SMARCE1-201ENST00000264640 SMARCA4P51532 1647 aa13.5□□□□□ -0.25
SMARCE1-201ENST00000264640 NPM3O75607 178 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SMARCE1-201ENST00000264640 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.44□□□□□ -0.26
SMARCE1-201ENST00000264640 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SMARCE1-201ENST00000264640 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.41□□□□□ -0.263e-7■■■□□ 15.4
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SMARCE1-201ENST00000264640 PDS5BQ9NTI5 1447 aa13.31□□□□□ -0.28
SMARCE1-201ENST00000264640 PEG3Q9GZU2 1588 aa13.3□□□□□ -0.28
SMARCE1-201ENST00000264640 MRC2Q9UBG0 1479 aa13.29□□□□□ -0.28
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR62O43379 1518 aa13.29□□□□□ -0.28
SMARCE1-201ENST00000264640 MROH2BQ7Z745 1585 aa13.21□□□□□ -0.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa13.2□□□□□ -0.3
SMARCE1-201ENST00000264640 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa13.2□□□□□ -0.3
SMARCE1-201ENST00000264640 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa13.2□□□□□ -0.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CADPSQ9ULU8 1353 aa13.18□□□□□ -0.3
SMARCE1-201ENST00000264640 OSCARQ8IYS5 282 aa13.16□□□□□ -0.3
SMARCE1-201ENST00000264640 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CEP164Q9UPV0 1460 aa13.15□□□□□ -0.3
SMARCE1-201ENST00000264640 WIZO95785 1651 aa13.09□□□□□ -0.31
SMARCE1-201ENST00000264640 FANCD2Q9BXW9 1451 aa13.09□□□□□ -0.31
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNA4P22459 653 aa13.07□□□□□ -0.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGEF11O15085 1522 aa13.06□□□□□ -0.32
SMARCE1-201ENST00000264640 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PRDM2Q13029 1718 aa12.96□□□□□ -0.33
SMARCE1-201ENST00000264640 DSG3P32926 999 aa12.96□□□□□ -0.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CHD1O14646 1710 aa12.96□□□□□ -0.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC4A2P04920 1241 aa12.95□□□□□ -0.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TRHP20396 242 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CFTRP13569 1480 aa12.95□□□□□ -0.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CAPN15O75808 1086 aa12.94□□□□□ -0.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CYB5RLQ6IPT4 315 aa12.94□□□□□ -0.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ARAP1Q96P48 1450 aa12.91□□□□□ -0.34
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
SMARCE1-201ENST00000264640 IFT140Q96RY7 1462 aa12.86□□□□□ -0.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TOPBP1Q92547 1522 aa12.8□□□□□ -0.36
SMARCE1-201ENST00000264640 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
SMARCE1-201ENST00000264640 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.75□□□□□ -0.37
SMARCE1-201ENST00000264640 FBLN2P98095 1184 aa12.74□□□□□ -0.37
SMARCE1-201ENST00000264640 APLP2Q06481 763 aa12.74□□□□□ -0.37
SMARCE1-201ENST00000264640 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.73□□□□□ -0.37
SMARCE1-201ENST00000264640 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
SMARCE1-201ENST00000264640 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.69□□□□□ -0.38
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