RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000076226.12

Herc2-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc2, Length 15,250 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2-201ENSMUST00000076226 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP7,99□□□□□ -1,13
Herc2-201ENSMUST00000076226 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa7,96□□□□□ -1,13
Herc2-201ENSMUST00000076226 Cngb1E1AZ71 1325 aa7,92□□□□□ -1,14
Herc2-201ENSMUST00000076226 Amer1Q7TS75 1132 aa7,83□□□□□ -1,16
Herc2-201ENSMUST00000076226 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP7,75□□□□□ -1,17
Herc2-201ENSMUST00000076226 Myt1Q8CFC2 1127 aa7,66□□□□□ -1,18
Herc2-201ENSMUST00000076226 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP7,55□□□□□ -1,2
Herc2-201ENSMUST00000076226 CenpbP27790 599 aa7,49□□□□□ -1,21
Herc2-201ENSMUST00000076226 Rhox8Q6VSS7 320 aa7,46□□□□□ -1,21
Herc2-201ENSMUST00000076226 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP7,46□□□□□ -1,21
Herc2-201ENSMUST00000076226 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa7,43□□□□□ -1,22
Herc2-201ENSMUST00000076226 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa7,4□□□□□ -1,23
Herc2-201ENSMUST00000076226 Wdr66E9Q743 1299 aa7,23□□□□□ -1,25
Herc2-201ENSMUST00000076226 Zeb1Q64318 1117 aa7,13□□□□□ -1,27
Herc2-201ENSMUST00000076226 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP7,08□□□□□ -1,28
Herc2-201ENSMUST00000076226 Rtl5Q5DTT4 599 aa7,06□□□□□ -1,28
Herc2-201ENSMUST00000076226 4933416C03RikQ3V063 378 aa7,05□□□□□ -1,28
Herc2-201ENSMUST00000076226 Rtl1Q7M732 1744 aa7,04□□□□□ -1,28
Herc2-201ENSMUST00000076226 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP6,96□□□□□ -1,29
Herc2-201ENSMUST00000076226 Stra8P70278 393 aa6,96□□□□□ -1,3
Herc2-201ENSMUST00000076226 Slc24a1Q91WD8 1130 aa6,95□□□□□ -1,3
Herc2-201ENSMUST00000076226 Pcgf6Q99NA9 353 aa6,89□□□□□ -1,31
Herc2-201ENSMUST00000076226 Tnnt3Q9QZ47 272 aa6,85□□□□□ -1,31
Herc2-201ENSMUST00000076226 Gm38655A0A286YDK6 273 aa6,83□□□□□ -1,32
Herc2-201ENSMUST00000076226 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP6,82□□□□□ -1,32
Herc2-201ENSMUST00000076226 Ccdc180J3QNE4 1664 aa6,81□□□□□ -1,32
Herc2-201ENSMUST00000076226 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa6,81□□□□□ -1,32
Herc2-201ENSMUST00000076226 Bcl11aQ9QYE3 773 aa6,78□□□□□ -1,32
Herc2-201ENSMUST00000076226 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP6,78□□□□□ -1,32
Herc2-201ENSMUST00000076226 NefmP08553 848 aa6,75□□□□□ -1,33
Herc2-201ENSMUST00000076226 Ube2uB1AUC4 352 aa6,74□□□□□ -1,33
Herc2-201ENSMUST00000076226 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP6,73□□□□□ -1,33
Herc2-201ENSMUST00000076226 Podxl2Q8CAE9 603 aa6,7□□□□□ -1,34
Herc2-201ENSMUST00000076226 Lmod3E9QA62 571 aa6,7□□□□□ -1,34
Herc2-201ENSMUST00000076226 DaxxO35613 739 aa6,7□□□□□ -1,34
Herc2-201ENSMUST00000076226 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP6,69□□□□□ -1,34
Herc2-201ENSMUST00000076226 Anp32aO35381 247 aa6,68□□□□□ -1,34
Herc2-201ENSMUST00000076226 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP6,68□□□□□ -1,34
Herc2-201ENSMUST00000076226 HrcG5E8J6 738 aa6,68□□□□□ -1,34
Herc2-201ENSMUST00000076226 CatipB9EKE5 520 aa6,68□□□□□ -1,34
Herc2-201ENSMUST00000076226 NeflP08551 543 aa6,65□□□□□ -1,35
Herc2-201ENSMUST00000076226 Aplp2Q06335 707 aa6,63□□□□□ -1,35
Herc2-201ENSMUST00000076226 Q8BT18 775 aa6,62□□□□□ -1,35
Herc2-201ENSMUST00000076226 Znf326O88291 580 aa6,6□□□□□ -1,35
Herc2-201ENSMUST00000076226 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP6,59□□□□□ -1,35
Herc2-201ENSMUST00000076226 Myt1lP97500 1187 aa6,58□□□□□ -1,36
Herc2-201ENSMUST00000076226 ArxO35085 564 aa6,58□□□□□ -1,36
Herc2-201ENSMUST00000076226 Pknox2Q8BG99 474 aa6,56□□□□□ -1,36
Herc2-201ENSMUST00000076226 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP6,56□□□□□ -1,36
Herc2-201ENSMUST00000076226 Neurod1Q60867 357 aa6,56□□□□□ -1,36
Herc2-201ENSMUST00000076226 Csrnp3P59055 597 aa6,55□□□□□ -1,36
Herc2-201ENSMUST00000076226 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP6,55□□□□□ -1,36
Herc2-201ENSMUST00000076226 Anks4bQ8K3X6 423 aa6,54□□□□□ -1,36
Herc2-201ENSMUST00000076226 Polr3glQ8R0C0 218 aa6,53□□□□□ -1,36
Herc2-201ENSMUST00000076226 Tnnt2P50752 301 aa6,53□□□□□ -1,36
Herc2-201ENSMUST00000076226 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa6,52□□□□□ -1,37
Herc2-201ENSMUST00000076226 BccipQ9CWI3 316 aa6,51□□□□□ -1,37
Herc2-201ENSMUST00000076226 Znf316Q6PGE4 1016 aa6,5□□□□□ -1,37
Herc2-201ENSMUST00000076226 Gab3Q8BSM5 595 aa6,5□□□□□ -1,37
Herc2-201ENSMUST00000076226 Taok2Q6ZQ29 1240 aa6,49□□□□□ -1,37
Herc2-201ENSMUST00000076226 Irx3P81067 507 aa6,47□□□□□ -1,37
Herc2-201ENSMUST00000076226 NrdcQ8BHG1 1161 aa6,47□□□□□ -1,37
Herc2-201ENSMUST00000076226 Vsig10D3YX43 558 aa6,46□□□□□ -1,38
Herc2-201ENSMUST00000076226 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa6,43□□□□□ -1,38
Herc2-201ENSMUST00000076226 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP6,42□□□□□ -1,38
Herc2-201ENSMUST00000076226 Ccdc27Q3V036 639 aa6,4□□□□□ -1,38
Herc2-201ENSMUST00000076226 Trim44Q9QXA7 346 aa6,39□□□□□ -1,39
Herc2-201ENSMUST00000076226 Fam71e1A1L3C1 212 aa6,38□□□□□ -1,39
Herc2-201ENSMUST00000076226 Zbtb4Q5F293 982 aa6,37□□□□□ -1,39
Herc2-201ENSMUST00000076226 UbtfP25976 765 aaKnown RBP6,37□□□□□ -1,39
Herc2-201ENSMUST00000076226 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa6,37□□□□□ -1,39
Herc2-201ENSMUST00000076226 Gtf3c5Q8R2T8 520 aa6,37□□□□□ -1,39
Herc2-201ENSMUST00000076226 ClspnQ80YR7 1315 aa6,35□□□□□ -1,39
Herc2-201ENSMUST00000076226 NclP09405 707 aaKnown RBP6,33□□□□□ -1,4
Herc2-201ENSMUST00000076226 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa6,33□□□□□ -1,4
Herc2-201ENSMUST00000076226 AU015836B2RUM3 263 aa6,32□□□□□ -1,4
Herc2-201ENSMUST00000076226 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa6,32□□□□□ -1,4
Herc2-201ENSMUST00000076226 PrkcshO08795 521 aa6,31□□□□□ -1,4
Herc2-201ENSMUST00000076226 IbspQ61711 324 aa6,3□□□□□ -1,4
Herc2-201ENSMUST00000076226 Adam1bQ8R534 806 aa6,3□□□□□ -1,4
Herc2-201ENSMUST00000076226 Calr4Q3TQS0 420 aa6,28□□□□□ -1,4
Herc2-201ENSMUST00000076226 TonslQ6NZL6 1363 aa6,28□□□□□ -1,4
Herc2-201ENSMUST00000076226 Map7d2A2AG50 781 aa6,28□□□□□ -1,4
Herc2-201ENSMUST00000076226 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa6,27□□□□□ -1,41
Herc2-201ENSMUST00000076226 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa6,26□□□□□ -1,41
Herc2-201ENSMUST00000076226 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa6,25□□□□□ -1,41
Herc2-201ENSMUST00000076226 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP6,25□□□□□ -1,41
Herc2-201ENSMUST00000076226 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP6,25□□□□□ -1,41
Herc2-201ENSMUST00000076226 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP6,24□□□□□ -1,41
Herc2-201ENSMUST00000076226 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP6,23□□□□□ -1,41
Herc2-201ENSMUST00000076226 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP6,23□□□□□ -1,41
Herc2-201ENSMUST00000076226 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP6,22□□□□□ -1,41
Herc2-201ENSMUST00000076226 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa6,21□□□□□ -1,42
Herc2-201ENSMUST00000076226 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP6,21□□□□□ -1,42
Herc2-201ENSMUST00000076226 Htatsf1Q8BGC0 757 aa6,21□□□□□ -1,42
Herc2-201ENSMUST00000076226 MsnP26041 577 aaKnown RBP6,2□□□□□ -1,42
Herc2-201ENSMUST00000076226 Trim41Q5NCC3 630 aa6,2□□□□□ -1,42
Herc2-201ENSMUST00000076226 Trim26Q99PN3 545 aa6,2□□□□□ -1,42
Herc2-201ENSMUST00000076226 Fam43aQ8BUP8 424 aa6,2□□□□□ -1,42
Herc2-201ENSMUST00000076226 Chic1Q8CBW7 227 aa6,19□□□□□ -1,42
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40,4 ms