Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Bcl11aQ9QYE3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
Bcl11aQ9QYE3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Bcl11aQ9QYE3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Bcl11aQ9QYE3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Bcl11aQ9QYE3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Bcl11aQ9QYE3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Bcl11aQ9QYE3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Bcl11aQ9QYE3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Bcl11aQ9QYE3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Bcl11aQ9QYE3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Bcl11aQ9QYE3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Bcl11aQ9QYE3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Bcl11aQ9QYE3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Bcl11aQ9QYE3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Bcl11aQ9QYE3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Bcl11aQ9QYE3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Bcl11aQ9QYE3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Bcl11aQ9QYE3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Bcl11aQ9QYE3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Bcl11aQ9QYE3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Bcl11aQ9QYE3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Bcl11aQ9QYE3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Bcl11aQ9QYE3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Bcl11aQ9QYE3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Bcl11aQ9QYE3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Bcl11aQ9QYE3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Bcl11aQ9QYE3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Bcl11aQ9QYE3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Bcl11aQ9QYE3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Bcl11aQ9QYE3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.2■■■■□ 3.38
Bcl11aQ9QYE3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Bcl11aQ9QYE3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Bcl11aQ9QYE3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Bcl11aQ9QYE3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Bcl11aQ9QYE3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Bcl11aQ9QYE3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Bcl11aQ9QYE3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Bcl11aQ9QYE3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Bcl11aQ9QYE3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Bcl11aQ9QYE3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Bcl11aQ9QYE3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Bcl11aQ9QYE3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Bcl11aQ9QYE3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Bcl11aQ9QYE3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Bcl11aQ9QYE3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Bcl11aQ9QYE3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Bcl11aQ9QYE3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Bcl11aQ9QYE3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Bcl11aQ9QYE3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Bcl11aQ9QYE3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Bcl11aQ9QYE3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Bcl11aQ9QYE3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Bcl11aQ9QYE3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Bcl11aQ9QYE3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Bcl11aQ9QYE3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Bcl11aQ9QYE3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Bcl11aQ9QYE3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Bcl11aQ9QYE3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Bcl11aQ9QYE3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Bcl11aQ9QYE3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Bcl11aQ9QYE3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Bcl11aQ9QYE3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Bcl11aQ9QYE3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Bcl11aQ9QYE3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Bcl11aQ9QYE3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Bcl11aQ9QYE3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Bcl11aQ9QYE3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Bcl11aQ9QYE3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Bcl11aQ9QYE3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Bcl11aQ9QYE3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Bcl11aQ9QYE3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Bcl11aQ9QYE3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Bcl11aQ9QYE3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Bcl11aQ9QYE3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Bcl11aQ9QYE3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Bcl11aQ9QYE3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Bcl11aQ9QYE3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Bcl11aQ9QYE3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Bcl11aQ9QYE3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Bcl11aQ9QYE3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Bcl11aQ9QYE3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Bcl11aQ9QYE3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Bcl11aQ9QYE3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Bcl11aQ9QYE3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Bcl11aQ9QYE3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Bcl11aQ9QYE3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Bcl11aQ9QYE3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Bcl11aQ9QYE3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Bcl11aQ9QYE3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Bcl11aQ9QYE3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Bcl11aQ9QYE3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Bcl11aQ9QYE3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Bcl11aQ9QYE3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Bcl11aQ9QYE3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Bcl11aQ9QYE3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Bcl11aQ9QYE3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms