Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,52■■■■■ 4,4
Bcl11aQ9QYE3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41,65■■■■■ 4,26
Bcl11aQ9QYE3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,35■■■■■ 4,21
Bcl11aQ9QYE3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,8■■■■□ 3,96
Bcl11aQ9QYE3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38,88■■■■□ 3,81
Bcl11aQ9QYE3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,62■■■■□ 3,77
Bcl11aQ9QYE3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,61■■■■□ 3,77
Bcl11aQ9QYE3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC38,53■■■■□ 3,76
Bcl11aQ9QYE3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38,52■■■■□ 3,76
Bcl11aQ9QYE3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,37■■■■□ 3,73
Bcl11aQ9QYE3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38,36■■■■□ 3,73
Bcl11aQ9QYE3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,3■■■■□ 3,72
Bcl11aQ9QYE3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Bcl11aQ9QYE3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,71■■■■□ 3,63
Bcl11aQ9QYE3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,63■■■■□ 3,61
Bcl11aQ9QYE3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,5■■■■□ 3,59
Bcl11aQ9QYE3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,48■■■■□ 3,59
Bcl11aQ9QYE3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Bcl11aQ9QYE3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,25■■■■□ 3,55
Bcl11aQ9QYE3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,02■■■■□ 3,52
Bcl11aQ9QYE3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36,99■■■■□ 3,51
Bcl11aQ9QYE3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36,71■■■■□ 3,47
Bcl11aQ9QYE3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Bcl11aQ9QYE3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36,62■■■■□ 3,45
Bcl11aQ9QYE3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Bcl11aQ9QYE3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Bcl11aQ9QYE3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,37■■■■□ 3,41
Bcl11aQ9QYE3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Bcl11aQ9QYE3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Bcl11aQ9QYE3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Bcl11aQ9QYE3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36,2■■■■□ 3,38
Bcl11aQ9QYE3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,14■■■■□ 3,38
Bcl11aQ9QYE3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Bcl11aQ9QYE3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Bcl11aQ9QYE3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC35,83■■■■□ 3,33
Bcl11aQ9QYE3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC35,69■■■■□ 3,3
Bcl11aQ9QYE3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35,67■■■■□ 3,3
Bcl11aQ9QYE3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,61■■■■□ 3,29
Bcl11aQ9QYE3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Bcl11aQ9QYE3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,54■■■■□ 3,28
Bcl11aQ9QYE3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Bcl11aQ9QYE3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Bcl11aQ9QYE3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Bcl11aQ9QYE3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,22■■■■□ 3,23
Bcl11aQ9QYE3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,22
Bcl11aQ9QYE3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Bcl11aQ9QYE3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Bcl11aQ9QYE3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Bcl11aQ9QYE3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Bcl11aQ9QYE3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Bcl11aQ9QYE3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Bcl11aQ9QYE3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Bcl11aQ9QYE3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Bcl11aQ9QYE3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,77■■■■□ 3,16
Bcl11aQ9QYE3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34,74■■■■□ 3,15
Bcl11aQ9QYE3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,72■■■■□ 3,15
Bcl11aQ9QYE3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Bcl11aQ9QYE3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Bcl11aQ9QYE3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Bcl11aQ9QYE3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Bcl11aQ9QYE3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Bcl11aQ9QYE3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Bcl11aQ9QYE3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Bcl11aQ9QYE3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Bcl11aQ9QYE3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Bcl11aQ9QYE3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Bcl11aQ9QYE3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,34■■■■□ 3,09
Bcl11aQ9QYE3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Bcl11aQ9QYE3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Bcl11aQ9QYE3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Bcl11aQ9QYE3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Bcl11aQ9QYE3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Bcl11aQ9QYE3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Bcl11aQ9QYE3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Bcl11aQ9QYE3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34,16■■■■□ 3,06
Bcl11aQ9QYE3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Bcl11aQ9QYE3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Bcl11aQ9QYE3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Bcl11aQ9QYE3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Bcl11aQ9QYE3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Bcl11aQ9QYE3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Bcl11aQ9QYE3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Bcl11aQ9QYE3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Bcl11aQ9QYE3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Bcl11aQ9QYE3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Bcl11aQ9QYE3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33,79■■■■□ 3
Bcl11aQ9QYE3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,75■■■□□ 2,99
Bcl11aQ9QYE3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Bcl11aQ9QYE3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,68■■■□□ 2,98
Bcl11aQ9QYE3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Bcl11aQ9QYE3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,65■■■□□ 2,98
Bcl11aQ9QYE3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,65■■■□□ 2,98
Bcl11aQ9QYE3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,62■■■□□ 2,97
Bcl11aQ9QYE3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Bcl11aQ9QYE3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Bcl11aQ9QYE3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33,58■■■□□ 2,97
Bcl11aQ9QYE3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms