Protein–RNA interactions for Protein: Q61711

Ibsp, Bone sialoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IbspQ61711 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
IbspQ61711 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
IbspQ61711 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
IbspQ61711 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
IbspQ61711 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
IbspQ61711 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
IbspQ61711 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
IbspQ61711 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
IbspQ61711 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
IbspQ61711 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
IbspQ61711 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
IbspQ61711 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
IbspQ61711 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
IbspQ61711 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
IbspQ61711 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
IbspQ61711 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
IbspQ61711 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
IbspQ61711 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
IbspQ61711 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
IbspQ61711 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
IbspQ61711 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
IbspQ61711 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
IbspQ61711 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
IbspQ61711 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
IbspQ61711 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
IbspQ61711 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
IbspQ61711 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
IbspQ61711 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
IbspQ61711 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
IbspQ61711 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
IbspQ61711 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
IbspQ61711 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
IbspQ61711 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
IbspQ61711 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
IbspQ61711 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
IbspQ61711 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
IbspQ61711 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
IbspQ61711 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
IbspQ61711 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
IbspQ61711 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
IbspQ61711 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
IbspQ61711 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
IbspQ61711 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
IbspQ61711 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
IbspQ61711 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
IbspQ61711 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
IbspQ61711 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
IbspQ61711 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
IbspQ61711 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
IbspQ61711 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
IbspQ61711 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IbspQ61711 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
IbspQ61711 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IbspQ61711 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IbspQ61711 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IbspQ61711 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IbspQ61711 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IbspQ61711 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IbspQ61711 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IbspQ61711 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IbspQ61711 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
IbspQ61711 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IbspQ61711 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IbspQ61711 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IbspQ61711 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IbspQ61711 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
IbspQ61711 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IbspQ61711 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IbspQ61711 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IbspQ61711 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IbspQ61711 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IbspQ61711 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
IbspQ61711 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IbspQ61711 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IbspQ61711 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IbspQ61711 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IbspQ61711 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IbspQ61711 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IbspQ61711 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IbspQ61711 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IbspQ61711 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IbspQ61711 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IbspQ61711 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IbspQ61711 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IbspQ61711 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IbspQ61711 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IbspQ61711 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IbspQ61711 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IbspQ61711 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
IbspQ61711 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
IbspQ61711 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IbspQ61711 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IbspQ61711 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IbspQ61711 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IbspQ61711 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
IbspQ61711 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IbspQ61711 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IbspQ61711 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IbspQ61711 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29■■■□□ 2.23
IbspQ61711 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms