RNA–Protein interactions for RNA: YOR120W

GCY1, Transcript of Glycerol dehydrogenase, yeast

Gene GCY1, Length 939 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GCY1	YOR120W	LRG1	P35688	1017 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	XKS1	P42826	600 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	TPP1	Q03796	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	PRO1	P32264	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	SEG2	P34250	1132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	PEX28	P38848	579 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	PEX7	P39108	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	SSY1	Q03770	852 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	NIT1	P40447	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	ORC3	P54790	616 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	ADI1	Q03677	179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	PTC7	P38797	343 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	IPL1	P38991	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	YNR063W	P53749	607 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	RKM2	Q03942	479 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	RNQ1	P25367	405 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	HEM3	P28789	327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	ADD66	P36040	267 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	YHL012W	P38709	493 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	FAA3	P39002	694 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	TOS4	Q06266	489 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCY1	YOR120W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	RDH54	P38086	958 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	UBP5	P39944	805 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	GTS1	P40956	396 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	VPS53	P47061	822 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	MDL2	P33311	773 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	TAF13	P11747	167 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	YJL045W	P47052	634 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	YGR122W	P53272	402 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	EST2	Q06163	884 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	MCD1	Q12158	566 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	SAM35	P14693	329 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	MGE1	P38523	228 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	MRPS18	P42847	217 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	PIC2	P40035	300 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	CDA2	Q06703	312 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GCY1	YOR120W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	ASF1	P32447	279 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	YSC84	P32793	468 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	AIM26	P32858	118 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	POL32	P47110	350 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
GCY1	YOR120W	PTC5	Q12511	572 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	COQ4	O13525	335 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	RAD2	P07276	1031 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	AFG2	P32794	780 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	HDA2	Q06629	674 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	CYC8	P14922	966 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	KIP1	P28742	1111 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	ALG3	P38179	458 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	CCZ1	P38273	704 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	ENT3	P47160	408 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	MRPL22	P53881	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	RSC58	Q07979	502 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	ENV11	P53246	860 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	TNA1	P53322	534 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	SIW14	P53965	281 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	SPS1	P08458	490 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	GPB2	P39717	880 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	SNO2	P53823	222 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	SEC8	P32855	1065 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	YJR107W	P47145	328 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	ROD1	Q02805	837 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	MRL1	Q06815	381 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	RSB1	Q08417	382 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	SPO21	Q12411	609 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GCY1	YOR120W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
GCY1	YOR120W	MCM2	P29469	868 aa		4.71	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 51.6 ms