RNA–Protein interactions for RNA: YML080W

DUS1, Transcript of Dihydrouridine synthase, yeast

Gene DUS1, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DUS1	YML080W	SRM1	P21827	482 aa		11.54	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	SPO11	P23179	398 aa		11.54	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	CDC15	P27636	974 aa		11.54	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	SAS3	P34218	831 aa		11.54	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	LEO1	P38439	464 aa		11.54	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	FOL1	P53848	824 aa		11.54	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	TUS1	Q06412	1307 aa		11.54	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	NUC1	P08466	329 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	CKA2	P19454	339 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	MRC1	P25588	1096 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	LTV1	P34078	463 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	YGR237C	P50089	785 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	MSN5	P52918	1224 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	VPS30	Q02948	557 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	APL4	Q12028	832 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DUS1	YML080W	PRI1	P10363	409 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.52	□□□□□ -0.57	not detected
DUS1	YML080W	CTM1	P38818	585 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	YJL171C	P46992	396 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	GIS4	Q04233	774 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	VPS38	Q05919	439 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	GAS5	Q08193	484 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	HMI1	Q12039	706 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	CTT1	P06115	562 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	YET1	P35723	206 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	CCC2	P38995	1004 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	ATG32	P40458	529 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	TRS120	Q04183	1289 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	YEL043W	P32618	956 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	YKU70	P32807	602 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	PCH2	P38126	564 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	CAJ1	P39101	391 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	MGA2	P40578	1113 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	UBA2	P52488	636 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	MAL13	P53338	473 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	DPL1	Q05567	589 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	MSH3	P25336	1018 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	CHS3	P29465	1165 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	GSM1	P42950	618 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	ERG5	P54781	538 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	AAD16	Q02895	342 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	FLO11	P08640	1367 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	MIP1	P15801	1254 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	DPB3	P27344	201 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	CIN4	P39110	191 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	ROG3	P43602	733 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	PSR2	Q07949	397 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	KIN1	P13185	1064 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	SEC65	P29478	273 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	BUD16	P39988	312 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	CSM3	Q04659	317 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	QCR6	P00127	147 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	PET123	P17558	318 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	ERG7	P38604	731 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	RTT107	P38850	1070 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	VFA1	P40080	203 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	DSE4	P53753	1117 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	CRF1	Q04930	467 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	ATG9	Q12142	997 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DUS1	YML080W	VPS45	P38932	577 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DUS1	YML080W	SHC1	P39000	512 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DUS1	YML080W	OSW7	P43611	510 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DUS1	YML080W	ASE1	P50275	885 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DUS1	YML080W	HFM1	P51979	1187 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DUS1	YML080W	LSB1	P53281	241 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DUS1	YML080W	LSC2	P53312	427 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DUS1	YML080W	KIN4	Q01919	800 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DUS1	YML080W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
DUS1	YML080W	PLP2	Q12017	286 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DUS1	YML080W	MCM16	Q12262	181 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DUS1	YML080W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
DUS1	YML080W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
DUS1	YML080W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
DUS1	YML080W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
DUS1	YML080W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58

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