RNA–Protein interactions for RNA: YKL036C

YKL036C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL036C, Length 393 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL036CYKL036C YUR1P26725 428 aa21.13■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C TFC4P33339 1025 aa21.13■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C NDT80P38830 627 aa21.13■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C LIF1P53150 421 aa21.13■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C RPL8AP17076 256 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C RNR3P21672 869 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C FIR1P40020 876 aa21.12■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C SPO22P40511 975 aa21.12■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C FMP30Q02883 468 aa21.12■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C TAO3P40468 2376 aa21.12■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C REG2P38232 338 aa21.11■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C NOC2P39744 710 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C YFL040WP43562 540 aa21.11■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C YGL039WP53183 348 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C MYO1P08964 1928 aa21.1■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data21.1■□□□□ 0.97not detected
YKL036CYKL036C PDC1P06169 563 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C PWP2P25635 923 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C WHI3P34761 661 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C DBP7P36120 742 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C SKP2P42843 763 aa21.09■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C KRI1P42846 591 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C TRM11Q12463 433 aa21.09■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C YDR461C-AQ2V2P7 80 aa21.09■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C POX1P13711 748 aa21.08■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C TIM23P32897 222 aa21.08■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C YMR321CQ04898 105 aa21.07■□□□□ 0.96
YKL036CYKL036C CIT1P00890 479 aa21.05■□□□□ 0.96
YKL036CYKL036C GPT2P36148 743 aa21.05■□□□□ 0.96
YKL036CYKL036C AIM9P40053 627 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
YKL036CYKL036C SCS3P53012 380 aa21.05■□□□□ 0.96
YKL036CYKL036C UGA4P32837 571 aa21.04■□□□□ 0.96
YKL036CYKL036C KTR2P33550 425 aa21.04■□□□□ 0.96
YKL036CYKL036C AKR1P39010 764 aa21.04■□□□□ 0.96
YKL036CYKL036C ECM23Q02710 187 aa21.04■□□□□ 0.96
YKL036CYKL036C YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
YKL036CYKL036C PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
YKL036CYKL036C VID28P40547 921 aa21.02■□□□□ 0.96
YKL036CYKL036C ASE1P50275 885 aa21.02■□□□□ 0.96
YKL036CYKL036C FBP26P32604 452 aa21.01■□□□□ 0.95
YKL036CYKL036C DAK1P54838 584 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
YKL036CYKL036C YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
YKL036CYKL036C PAN5P38787 379 aa21■□□□□ 0.95
YKL036CYKL036C RTP1Q12751 981 aa20.99■□□□□ 0.95
YKL036CYKL036C MET6P05694 767 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
YKL036CYKL036C CTR1P49573 406 aa20.98■□□□□ 0.95
YKL036CYKL036C ARP5P53946 755 aa20.98■□□□□ 0.95
YKL036CYKL036C EAR1Q03212 550 aa20.98■□□□□ 0.95
YKL036CYKL036C SES1P07284 462 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
YKL036CYKL036C AVT3P36062 692 aa20.97■□□□□ 0.95
YKL036CYKL036C CCT3P39077 534 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
YKL036CYKL036C STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data20.96■□□□□ 0.95not detected
YKL036CYKL036C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
YKL036CYKL036C TRL1P09880 827 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C HEM1P09950 548 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C SUL1P38359 859 aa20.95■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C YKE2P52553 114 aa20.95■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C OXR1Q08952 273 aa20.95■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C BMH2P34730 273 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C OPY1P38271 328 aa20.94■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C MIP1P15801 1254 aa20.93■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C RXT2P38255 430 aa20.93■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C EPL1P43572 832 aa20.93■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C UBP15P50101 1230 aa20.93■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C SNA3P14359 133 aa20.92■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C FLR1P38124 548 aa20.92■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C HUL5P53119 910 aa20.92■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C GDE1Q02979 1223 aa20.92■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C YDR524C-BQ3E6R4 66 aa20.92■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C MATALPHA2P0CY08 210 aa20.91■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C HMLALPHA2P0CY09 210 aa20.91■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C MAS2P11914 482 aa20.91■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C MAK11P20484 414 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C PCI8P40512 444 aa20.91■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C ARP6Q12509 438 aa20.91■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C HCA4P20448 770 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C SWI4P25302 1093 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C RPS7BP48164 190 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C YLL058WQ12198 575 aa20.9■□□□□ 0.94
YKL036CYKL036C SMD2Q06217 110 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
YKL036CYKL036C LDB19Q12502 818 aa20.89■□□□□ 0.93
YKL036CYKL036C CLB5P30283 435 aa20.87■□□□□ 0.93
YKL036CYKL036C SAS3P34218 831 aa20.87■□□□□ 0.93
YKL036CYKL036C VPS72Q03388 795 aa20.87■□□□□ 0.93
YKL036CYKL036C HMF1P40037 129 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
YKL036CYKL036C YGL138CP53122 345 aa20.86■□□□□ 0.93
YKL036CYKL036C BNI5P53890 448 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
YKL036CYKL036C YVH1Q02256 364 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
YKL036CYKL036C MSC2Q03455 724 aa20.86■□□□□ 0.93
YKL036CYKL036C OYE2Q03558 400 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
YKL036CYKL036C GIS4Q04233 774 aa20.86■□□□□ 0.93
YKL036CYKL036C WHI4Q07655 649 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
YKL036CYKL036C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
YKL036CYKL036C SRO9P25567 434 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
YKL036CYKL036C GRS1P38088 690 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
YKL036CYKL036C RPN10P38886 268 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 69.8 ms