RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDI1	YER143W	VPS30	Q02948	557 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDI1	YER143W	CSR2	Q12734	1121 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDI1	YER143W	AIM44	Q99299	758 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDI1	YER143W	NUC1	P08466	329 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDI1	YER143W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
DDI1	YER143W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
DDI1	YER143W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
DDI1	YER143W	PES4	P39684	611 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDI1	YER143W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
DDI1	YER143W	YDL129W	Q07555	291 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDI1	YER143W	DSE3	Q08729	430 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDI1	YER143W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
DDI1	YER143W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	GDE1	Q02979	1223 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	YGL138C	P53122	345 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	MDM1	Q01846	1127 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	LAP2	Q10740	671 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	ASF1	P32447	279 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	SAP30	P38429	201 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	PEA2	P40091	420 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.11	□□□□□ -0.79	not detected
DDI1	YER143W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	COG8	Q04632	607 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	APC11	Q12157	165 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	CIT1	P00890	479 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	CLC1	P17891	233 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	RPN12	P32496	274 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	FAR11	P53917	953 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	GAL2	P13181	574 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	ACA1	P39970	489 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	SUE1	Q06524	206 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	CEX1	Q12453	761 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	PTC5	Q12511	572 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDI1	YER143W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	VPS45	P38932	577 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	VHR2	P40041	505 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	RSM25	P40496	264 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	ASE1	P50275	885 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	GIS4	Q04233	774 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	TOM1	Q03280	3268 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	DID4	P36108	232 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	PNT1	P38969	423 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	RET3	P53600	189 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	YIL089W	P40500	205 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	YPT11	P48559	417 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	ERG12	P07277	443 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	ALG1	P16661	449 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	RGP1	P16664	663 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	RKM3	P38222	552 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	SOL3	P38858	249 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	LYS14	P40971	790 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	SOL4	P53315	255 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	GPA1	P08539	472 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	NPR3	P38742	1146 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	NDT80	P38830	627 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	PEX21	P50091	288 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	YML037C	Q03703	340 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	CSC1	Q06538	782 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	GIN4	Q12263	1142 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	FBP1	P09201	348 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	YER130C	P39959	443 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	YGR153W	P48238	217 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	PEX29	Q03370	554 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	MMR1	Q06324	491 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	YOR296W	Q08748	1289 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	TIP41	Q12199	356 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	TRS33	Q99394	268 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.8
DDI1	YER143W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
DDI1	YER143W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
DDI1	YER143W	SEC20	P28791	383 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDI1	YER143W	PAN5	P38787	379 aa		10.02	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 144.3 ms