RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	RTA1	P53047	317 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	RSC1	P53236	928 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	MET14	Q02196	202 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	HPF1	Q05164	967 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	APC11	Q12157	165 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	MCD1	Q12158	566 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	DPH6	Q12429	685 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	TCB1	Q12466	1186 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	RTP1	Q12751	981 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	ARE1	P25628	610 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	EUG1	P32474	517 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	TFC4	P33339	1025 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	PTH2	P34222	208 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	TAF1	P46677	1066 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	SRB7	P47822	140 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	GPG1	P53130	126 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	TLG1	Q03322	224 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	FMP25	Q08023	583 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	CYB2	P00175	591 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	SPS1	P08458	490 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	HOM3	P10869	527 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	STE6	P12866	1290 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	UBP1	P25037	809 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	PPH3	P32345	308 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	PLC1	P32383	869 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	DLD1	P32891	587 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	OSH7	P38755	437 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	PES4	P39684	611 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	GEM1	P39722	662 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	ROG3	P43602	733 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	YNL193W	P53870	558 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	YML131W	Q03102	365 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	UGO1	Q03327	502 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	EAF1	Q06337	982 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	IRC3	Q06683	689 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	TRE2	Q08693	809 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	GAL1	P04385	528 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	KTR2	P33550	425 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	MNT3	P40549	630 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	HUL4	P40985	892 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	LYS5	P50113	272 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	SPC19	Q03954	165 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	CAB1	Q04430	367 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	DFG5	Q05031	458 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	BSC2	Q05611	235 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	PHM6	Q05637	104 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	HDA3	Q06623	655 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	REH1	Q06709	432 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	GCR1	P07261	785 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	RIM4	P38741	713 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	MEP1	P40260	492 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	ERP6	P53198	216 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	RSC4	Q02206	625 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	EEB1	Q02891	456 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SLX8	YER116C	MSM1	P22438	575 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	BRF1	P29056	596 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	PTP2	P29461	750 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	BET3	P36149	193 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	APE4	P38821	490 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	ESL1	P40456	1118 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	VTC2	P43585	828 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	BNA1	P47096	177 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	GPI8	P49018	411 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	CTF4	Q01454	927 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	ERO1	Q03103	563 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	TAF8	Q03750	510 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	PSR1	Q07800	427 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	PSR2	Q07949	397 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	CHS3	P29465	1165 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	MCM10	P32354	571 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SLX8	YER116C	ANP1	P32629	500 aa		4.7	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 82.4 ms