RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034452.11

Ccsap-201, Transcript of Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccsap, Length 2,390 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa27.93■■■□□ 2.06
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
Ccsap-201ENSMUST00000034452 RictorQ6QI06 1708 aa27.92■■■□□ 2.06
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa27.91■■■□□ 2.06
Ccsap-201ENSMUST00000034452 SlkO54988 1233 aa27.91■■■□□ 2.06
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mdc1Q5PSV9 1707 aa27.9■■■□□ 2.06
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Med1Q925J9 1575 aa27.9■■■□□ 2.06
Ccsap-201ENSMUST00000034452 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa27.89■■■□□ 2.06
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa27.88■■■□□ 2.05
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tmx3Q8BXZ1 456 aa27.88■■■□□ 2.05
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Atg4aQ8C9S8 396 aa27.88■■■□□ 2.05
Ccsap-201ENSMUST00000034452 IghaA0A0A6YXW6 389 aa27.88■■■□□ 2.05
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Sirt1Q923E4 737 aa27.88■■■□□ 2.05
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa27.88■■■□□ 2.05
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Trim44Q9QXA7 346 aa27.87■■■□□ 2.05
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa27.85■■■□□ 2.05
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cyp27a1Q9DBG1 533 aa27.85■■■□□ 2.05
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Znf335A2A5K6 1337 aa27.85■■■□□ 2.05
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Dip2bQ3UH60 1574 aa27.85■■■□□ 2.05
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tet3Q8BG87 1668 aa27.84■■■□□ 2.05
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rasa1E9PYG6 1038 aa27.84■■■□□ 2.05
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pibf1E9Q6K3 756 aa27.84■■■□□ 2.05
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ggnbp2Q5SV77 696 aa27.84■■■□□ 2.05
Ccsap-201ENSMUST00000034452 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
Ccsap-201ENSMUST00000034452 CemipQ8BI06 1361 aa27.82■■■□□ 2.04
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zfp777B9EKF4 885 aa27.82■■■□□ 2.04
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Erc2Q6PH08 957 aa27.82■■■□□ 2.04
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Sv2bQ8BG39 683 aa27.82■■■□□ 2.04
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Q9D2X8 372 aa27.81■■■□□ 2.04
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rnf123Q5XPI3 1314 aa27.81■■■□□ 2.04
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
Ccsap-201ENSMUST00000034452 ImpactO55091 318 aa27.8■■■□□ 2.04
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
Ccsap-201ENSMUST00000034452 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa27.78■■■□□ 2.04
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Prim1P20664 417 aa27.78■■■□□ 2.04
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Slit3Q9WVB4 1523 aa27.77■■■□□ 2.04
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ap3b2Q9JME5 1082 aa27.77■■■□□ 2.04
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Slit2Q9R1B9 1521 aa27.76■■■□□ 2.04
Ccsap-201ENSMUST00000034452 NalcnQ8BXR5 1738 aa27.76■■■□□ 2.04
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Bcar3Q9QZK2 820 aa27.75■■■□□ 2.03
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zkscan16A2ALW2 728 aa27.75■■■□□ 2.03
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Vsig10D3YX43 558 aa27.74■■■□□ 2.03
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zkscan2G3X952 960 aa27.74■■■□□ 2.03
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
Ccsap-201ENSMUST00000034452 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Q3UJC8 639 aa27.73■■■□□ 2.03
Ccsap-201ENSMUST00000034452 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Igsf1Q7TQA1 1317 aa27.73■■■□□ 2.03
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zdhhc9P59268 364 aa27.73■■■□□ 2.03
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ddrgk1Q80WW9 315 aa27.72■■■□□ 2.03
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nphp1Q9QY53 687 aa27.72■■■□□ 2.03
Ccsap-201ENSMUST00000034452 PzpQ61838 1495 aa27.71■■■□□ 2.03
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Dnajc5P60904 198 aa27.71■■■□□ 2.03
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Srgap3Q812A2 1099 aa27.71■■■□□ 2.03
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa27.7■■■□□ 2.03
Ccsap-201ENSMUST00000034452 RestQ8VIG1 1082 aa27.7■■■□□ 2.03
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 NgefQ8CHT1 710 aa27.7■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Fam83gQ5SWY7 812 aa27.69■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Snap23O09044 210 aa27.68■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa27.68■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 FancaQ9JL70 1439 aa27.68■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Vwa3bJ9JI28 736 aa27.67■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Eya1P97767 591 aa27.67■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa27.67■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gdpd2Q9ESM6 539 aa27.67■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mmp8O70138 465 aa27.66■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 NexnQ7TPW1 607 aa27.66■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 4931400O07RikQ9D4M5 137 aa27.66■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ubr1O70481 1757 aa27.65■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 PtmaP26350 111 aa27.65■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Q3TQI7 289 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Parp14Q2EMV9 1817 aa27.65■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 CalcaP70160 136 aa27.65■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Atp8b2P98199 1209 aa27.64■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Dennd6aQ8BH65 605 aa27.64■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Hmox1P14901 289 aa27.64■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Prune1Q8BIW1 454 aa27.64■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pik3c2aQ61194 1686 aa27.64■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm9992B2RWK3 458 aa27.63■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 MccE9PWI3 1003 aa27.63■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Unc93aQ710D3 458 aa27.63■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Trpm3Q5F4S9 1721 aa27.63■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Stk36Q69ZM6 1316 aa27.62■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Col16a1Q8BLX7 1580 aa27.62■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Camta1A2A891 1682 aa27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.5 ms