Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXZ1

Tmx3, Protein disulfide-isomerase TMX3, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx3Q8BXZ1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Tmx3Q8BXZ1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Tmx3Q8BXZ1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Tmx3Q8BXZ1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
Tmx3Q8BXZ1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
Tmx3Q8BXZ1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Tmx3Q8BXZ1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Tmx3Q8BXZ1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Tmx3Q8BXZ1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Tmx3Q8BXZ1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Tmx3Q8BXZ1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Tmx3Q8BXZ1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Tmx3Q8BXZ1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Tmx3Q8BXZ1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Tmx3Q8BXZ1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Tmx3Q8BXZ1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Tmx3Q8BXZ1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Tmx3Q8BXZ1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Tmx3Q8BXZ1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
Tmx3Q8BXZ1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Tmx3Q8BXZ1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Tmx3Q8BXZ1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Tmx3Q8BXZ1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Tmx3Q8BXZ1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Tmx3Q8BXZ1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Tmx3Q8BXZ1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Tmx3Q8BXZ1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Tmx3Q8BXZ1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Tmx3Q8BXZ1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Tmx3Q8BXZ1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Tmx3Q8BXZ1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Tmx3Q8BXZ1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Tmx3Q8BXZ1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Tmx3Q8BXZ1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Tmx3Q8BXZ1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Tmx3Q8BXZ1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Tmx3Q8BXZ1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Tmx3Q8BXZ1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Tmx3Q8BXZ1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Tmx3Q8BXZ1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Tmx3Q8BXZ1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Tmx3Q8BXZ1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Tmx3Q8BXZ1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Tmx3Q8BXZ1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Tmx3Q8BXZ1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Tmx3Q8BXZ1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Tmx3Q8BXZ1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Tmx3Q8BXZ1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Tmx3Q8BXZ1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Tmx3Q8BXZ1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Tmx3Q8BXZ1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Tmx3Q8BXZ1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Tmx3Q8BXZ1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Tmx3Q8BXZ1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Tmx3Q8BXZ1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Tmx3Q8BXZ1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tmx3Q8BXZ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tmx3Q8BXZ1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tmx3Q8BXZ1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Tmx3Q8BXZ1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Tmx3Q8BXZ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tmx3Q8BXZ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Tmx3Q8BXZ1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Tmx3Q8BXZ1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Tmx3Q8BXZ1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Tmx3Q8BXZ1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Tmx3Q8BXZ1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Tmx3Q8BXZ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Tmx3Q8BXZ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Tmx3Q8BXZ1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Tmx3Q8BXZ1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Tmx3Q8BXZ1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Tmx3Q8BXZ1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Tmx3Q8BXZ1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Tmx3Q8BXZ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Tmx3Q8BXZ1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Tmx3Q8BXZ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Tmx3Q8BXZ1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tmx3Q8BXZ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tmx3Q8BXZ1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tmx3Q8BXZ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Tmx3Q8BXZ1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tmx3Q8BXZ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tmx3Q8BXZ1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Tmx3Q8BXZ1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tmx3Q8BXZ1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Tmx3Q8BXZ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tmx3Q8BXZ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tmx3Q8BXZ1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tmx3Q8BXZ1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tmx3Q8BXZ1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Tmx3Q8BXZ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Tmx3Q8BXZ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Tmx3Q8BXZ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Tmx3Q8BXZ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Tmx3Q8BXZ1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Tmx3Q8BXZ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Tmx3Q8BXZ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Tmx3Q8BXZ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Tmx3Q8BXZ1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms