Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4M5

4931400O07Rik, MCG14882, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931400O07RikQ9D4M5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,04■■■■■ 4
4931400O07RikQ9D4M5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,58■■■■□ 3,77
4931400O07RikQ9D4M5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,45■■■■□ 3,75
4931400O07RikQ9D4M5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,12■■■■□ 3,69
4931400O07RikQ9D4M5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,68■■■■□ 3,62
4931400O07RikQ9D4M5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
4931400O07RikQ9D4M5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
4931400O07RikQ9D4M5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
4931400O07RikQ9D4M5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
4931400O07RikQ9D4M5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,34
4931400O07RikQ9D4M5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
4931400O07RikQ9D4M5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
4931400O07RikQ9D4M5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
4931400O07RikQ9D4M5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
4931400O07RikQ9D4M5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
4931400O07RikQ9D4M5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
4931400O07RikQ9D4M5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,12■■■■□ 3,21
4931400O07RikQ9D4M5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35,05■■■■□ 3,2
4931400O07RikQ9D4M5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
4931400O07RikQ9D4M5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
4931400O07RikQ9D4M5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
4931400O07RikQ9D4M5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
4931400O07RikQ9D4M5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,59■■■■□ 3,13
4931400O07RikQ9D4M5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
4931400O07RikQ9D4M5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
4931400O07RikQ9D4M5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
4931400O07RikQ9D4M5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,24■■■■□ 3,07
4931400O07RikQ9D4M5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
4931400O07RikQ9D4M5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,11■■■■□ 3,05
4931400O07RikQ9D4M5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
4931400O07RikQ9D4M5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
4931400O07RikQ9D4M5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,96■■■■□ 3,03
4931400O07RikQ9D4M5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
4931400O07RikQ9D4M5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,94■■■■□ 3,02
4931400O07RikQ9D4M5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,88■■■■□ 3,01
4931400O07RikQ9D4M5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,85■■■■□ 3,01
4931400O07RikQ9D4M5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
4931400O07RikQ9D4M5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
4931400O07RikQ9D4M5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
4931400O07RikQ9D4M5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,73■■■□□ 2,99
4931400O07RikQ9D4M5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
4931400O07RikQ9D4M5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,98
4931400O07RikQ9D4M5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
4931400O07RikQ9D4M5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
4931400O07RikQ9D4M5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
4931400O07RikQ9D4M5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
4931400O07RikQ9D4M5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,34■■■□□ 2,93
4931400O07RikQ9D4M5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
4931400O07RikQ9D4M5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
4931400O07RikQ9D4M5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
4931400O07RikQ9D4M5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
4931400O07RikQ9D4M5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33,26■■■□□ 2,92
4931400O07RikQ9D4M5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
4931400O07RikQ9D4M5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
4931400O07RikQ9D4M5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
4931400O07RikQ9D4M5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
4931400O07RikQ9D4M5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,86■■■□□ 2,85
4931400O07RikQ9D4M5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,85
4931400O07RikQ9D4M5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
4931400O07RikQ9D4M5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
4931400O07RikQ9D4M5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
4931400O07RikQ9D4M5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
4931400O07RikQ9D4M5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,61■■■□□ 2,81
4931400O07RikQ9D4M5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
4931400O07RikQ9D4M5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,53■■■□□ 2,8
4931400O07RikQ9D4M5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
4931400O07RikQ9D4M5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,48■■■□□ 2,79
4931400O07RikQ9D4M5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
4931400O07RikQ9D4M5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
4931400O07RikQ9D4M5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32,42■■■□□ 2,78
4931400O07RikQ9D4M5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
4931400O07RikQ9D4M5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
4931400O07RikQ9D4M5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32,25■■■□□ 2,75
4931400O07RikQ9D4M5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
4931400O07RikQ9D4M5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
4931400O07RikQ9D4M5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
4931400O07RikQ9D4M5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
4931400O07RikQ9D4M5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
4931400O07RikQ9D4M5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
4931400O07RikQ9D4M5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
4931400O07RikQ9D4M5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32,04■■■□□ 2,72
4931400O07RikQ9D4M5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
4931400O07RikQ9D4M5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
4931400O07RikQ9D4M5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,97■■■□□ 2,71
4931400O07RikQ9D4M5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
4931400O07RikQ9D4M5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,88■■■□□ 2,69
4931400O07RikQ9D4M5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
4931400O07RikQ9D4M5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
4931400O07RikQ9D4M5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,82■■■□□ 2,68
4931400O07RikQ9D4M5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
4931400O07RikQ9D4M5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
4931400O07RikQ9D4M5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,68
4931400O07RikQ9D4M5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
4931400O07RikQ9D4M5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
4931400O07RikQ9D4M5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31,74■■■□□ 2,67
4931400O07RikQ9D4M5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,69■■■□□ 2,66
4931400O07RikQ9D4M5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
4931400O07RikQ9D4M5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
4931400O07RikQ9D4M5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,65■■■□□ 2,66
4931400O07RikQ9D4M5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,63■■■□□ 2,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,2 ms