Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42■■■■■ 4.31
Cyp27a1Q9DBG1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Cyp27a1Q9DBG1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Cyp27a1Q9DBG1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Cyp27a1Q9DBG1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
Cyp27a1Q9DBG1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Cyp27a1Q9DBG1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cyp27a1Q9DBG1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Cyp27a1Q9DBG1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Cyp27a1Q9DBG1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Cyp27a1Q9DBG1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Cyp27a1Q9DBG1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Cyp27a1Q9DBG1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Cyp27a1Q9DBG1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cyp27a1Q9DBG1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Cyp27a1Q9DBG1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cyp27a1Q9DBG1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cyp27a1Q9DBG1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cyp27a1Q9DBG1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Cyp27a1Q9DBG1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cyp27a1Q9DBG1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cyp27a1Q9DBG1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cyp27a1Q9DBG1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Cyp27a1Q9DBG1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cyp27a1Q9DBG1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cyp27a1Q9DBG1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Cyp27a1Q9DBG1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cyp27a1Q9DBG1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cyp27a1Q9DBG1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cyp27a1Q9DBG1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cyp27a1Q9DBG1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cyp27a1Q9DBG1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cyp27a1Q9DBG1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Cyp27a1Q9DBG1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Cyp27a1Q9DBG1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Cyp27a1Q9DBG1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Cyp27a1Q9DBG1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cyp27a1Q9DBG1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cyp27a1Q9DBG1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cyp27a1Q9DBG1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cyp27a1Q9DBG1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Cyp27a1Q9DBG1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cyp27a1Q9DBG1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cyp27a1Q9DBG1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cyp27a1Q9DBG1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Cyp27a1Q9DBG1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cyp27a1Q9DBG1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cyp27a1Q9DBG1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Cyp27a1Q9DBG1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cyp27a1Q9DBG1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cyp27a1Q9DBG1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cyp27a1Q9DBG1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cyp27a1Q9DBG1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cyp27a1Q9DBG1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cyp27a1Q9DBG1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cyp27a1Q9DBG1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cyp27a1Q9DBG1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cyp27a1Q9DBG1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cyp27a1Q9DBG1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cyp27a1Q9DBG1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cyp27a1Q9DBG1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cyp27a1Q9DBG1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cyp27a1Q9DBG1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cyp27a1Q9DBG1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cyp27a1Q9DBG1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cyp27a1Q9DBG1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cyp27a1Q9DBG1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cyp27a1Q9DBG1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cyp27a1Q9DBG1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Cyp27a1Q9DBG1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cyp27a1Q9DBG1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cyp27a1Q9DBG1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cyp27a1Q9DBG1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cyp27a1Q9DBG1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cyp27a1Q9DBG1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cyp27a1Q9DBG1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cyp27a1Q9DBG1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cyp27a1Q9DBG1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cyp27a1Q9DBG1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cyp27a1Q9DBG1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cyp27a1Q9DBG1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Cyp27a1Q9DBG1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cyp27a1Q9DBG1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms