RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 EngaseQ8BX80 734 aa27,1■■□□□ 1,93
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CemipQ8BI06 1361 aa27,08■■□□□ 1,93
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arap3Q8R5G7 1538 aa27,01■■□□□ 1,91
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atg4aQ8C9S8 396 aa26,97■■□□□ 1,91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ggnbp2Q5SV77 696 aa26,97■■□□□ 1,91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Col16a1Q8BLX7 1580 aa26,97■■□□□ 1,91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ptpn23Q6PB44 1692 aa26,97■■□□□ 1,91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Q3UJC8 639 aa26,96■■□□□ 1,91
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rnf123Q5XPI3 1314 aa26,95■■□□□ 1,91
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa26,94■■□□□ 1,9
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Camta1A2A891 1682 aa26,93■■□□□ 1,9
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rims2Q9EQZ7 1530 aa26,93■■□□□ 1,9
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mon2Q80TL7 1715 aa26,93■■□□□ 1,9
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pibf1E9Q6K3 756 aa26,93■■□□□ 1,9
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP26,93■■□□□ 1,9
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa26,93■■□□□ 1,9
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Abcc10Q8R4P9 1501 aa26,92■■□□□ 1,9
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Igsf1Q7TQA1 1317 aa26,92■■□□□ 1,9
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmx3Q8BXZ1 456 aa26,88■■□□□ 1,89
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ap3b2Q9JME5 1082 aa26,88■■□□□ 1,89
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Erc2Q6PH08 957 aa26,87■■□□□ 1,89
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP26,87■■□□□ 1,89
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Q9D2X8 372 aa26,86■■□□□ 1,89
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa26,86■■□□□ 1,89
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa26,85■■□□□ 1,89
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 C5P06684 1680 aa26,85■■□□□ 1,89
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Als2Q920R0 1651 aa26,85■■□□□ 1,89
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Myo5bP21271 1818 aa26,85■■□□□ 1,89
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP26,85■■□□□ 1,89
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Eya1P97767 591 aa26,85■■□□□ 1,89
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NgefQ8CHT1 710 aa26,84■■□□□ 1,89
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 SlkO54988 1233 aa26,84■■□□□ 1,89
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP26,84■■□□□ 1,89
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Snap23O09044 210 aa26,83■■□□□ 1,89
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dennd6aQ8BH65 605 aa26,83■■□□□ 1,89
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zkscan2G3X952 960 aa26,82■■□□□ 1,88
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam83gQ5SWY7 812 aa26,82■■□□□ 1,88
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP26,82■■□□□ 1,88
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nlgn1Q99K10 843 aa26,81■■□□□ 1,88
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nphp1Q9QY53 687 aa26,81■■□□□ 1,88
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 ImpactO55091 318 aa26,81■■□□□ 1,88
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zkscan16A2ALW2 728 aa26,8■■□□□ 1,88
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa26,79■■□□□ 1,88
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP26,79■■□□□ 1,88
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rad17Q6NXW6 688 aa26,78■■□□□ 1,88
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Srgap3Q812A2 1099 aa26,78■■□□□ 1,88
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa26,78■■□□□ 1,88
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 RestQ8VIG1 1082 aa26,78■■□□□ 1,88
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mmp8O70138 465 aa26,78■■□□□ 1,88
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa26,78■■□□□ 1,88
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arfgef2A2A5R2 1792 aa26,78■■□□□ 1,88
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hoxa7P02830 229 aa26,77■■□□□ 1,88
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Stk36Q69ZM6 1316 aa26,77■■□□□ 1,88
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Idi1P58044 227 aa26,76■■□□□ 1,87
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zdhhc9P59268 364 aa26,76■■□□□ 1,87
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cabp4Q8VHC5 271 aa26,76■■□□□ 1,87
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trim44Q9QXA7 346 aa26,76■■□□□ 1,87
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atp8b2P98199 1209 aa26,75■■□□□ 1,87
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