Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49,65■■■■■ 5,54
Myo5bP21271 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC46,05■■■■■ 4,96
Myo5bP21271 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,94■■■■■ 4,79
Myo5bP21271 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43,59■■■■■ 4,57
Myo5bP21271 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43,25■■■■■ 4,51
Myo5bP21271 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,17■■■■■ 4,5
Myo5bP21271 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42,99■■■■■ 4,47
Myo5bP21271 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,18■■■■■ 4,34
Myo5bP21271 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,09■■■■■ 4,33
Myo5bP21271 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4,31
Myo5bP21271 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,66■■■■■ 4,26
Myo5bP21271 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41,39■■■■■ 4,22
Myo5bP21271 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41,38■■■■■ 4,21
Myo5bP21271 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,32■■■■■ 4,2
Myo5bP21271 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Myo5bP21271 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40,54■■■■■ 4,08
Myo5bP21271 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,4■■■■■ 4,06
Myo5bP21271 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,23■■■■■ 4,03
Myo5bP21271 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,05■■■■■ 4
Myo5bP21271 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40,02■■■■■ 4
Myo5bP21271 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,92■■■■□ 3,98
Myo5bP21271 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,9■■■■□ 3,98
Myo5bP21271 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39,86■■■■□ 3,97
Myo5bP21271 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,85■■■■□ 3,97
Myo5bP21271 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39,84■■■■□ 3,97
Myo5bP21271 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39,77■■■■□ 3,96
Myo5bP21271 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39,75■■■■□ 3,95
Myo5bP21271 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,7■■■■□ 3,95
Myo5bP21271 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,67■■■■□ 3,94
Myo5bP21271 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Myo5bP21271 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,42■■■■□ 3,9
Myo5bP21271 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
Myo5bP21271 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,35■■■■□ 3,89
Myo5bP21271 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,31■■■■□ 3,88
Myo5bP21271 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39,13■■■■□ 3,85
Myo5bP21271 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39,04■■■■□ 3,84
Myo5bP21271 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39,01■■■■□ 3,84
Myo5bP21271 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,73■■■■□ 3,79
Myo5bP21271 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,53■■■■□ 3,76
Myo5bP21271 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38,51■■■■□ 3,76
Myo5bP21271 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,43■■■■□ 3,74
Myo5bP21271 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,37■■■■□ 3,73
Myo5bP21271 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38,35■■■■□ 3,73
Myo5bP21271 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,29■■■■□ 3,72
Myo5bP21271 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38,29■■■■□ 3,72
Myo5bP21271 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,26■■■■□ 3,72
Myo5bP21271 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,24■■■■□ 3,71
Myo5bP21271 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38,21■■■■□ 3,71
Myo5bP21271 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38,18■■■■□ 3,7
Myo5bP21271 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,17■■■■□ 3,7
Myo5bP21271 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37,95■■■■□ 3,67
Myo5bP21271 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
Myo5bP21271 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37,87■■■■□ 3,65
Myo5bP21271 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,84■■■■□ 3,65
Myo5bP21271 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,65
Myo5bP21271 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,75■■■■□ 3,63
Myo5bP21271 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37,7■■■■□ 3,63
Myo5bP21271 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37,66■■■■□ 3,62
Myo5bP21271 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Myo5bP21271 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,41■■■■□ 3,58
Myo5bP21271 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Myo5bP21271 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,57
Myo5bP21271 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,36■■■■□ 3,57
Myo5bP21271 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,36■■■■□ 3,57
Myo5bP21271 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37,36■■■■□ 3,57
Myo5bP21271 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37,31■■■■□ 3,56
Myo5bP21271 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
Myo5bP21271 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37,17■■■■□ 3,54
Myo5bP21271 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37,13■■■■□ 3,53
Myo5bP21271 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
Myo5bP21271 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37,06■■■■□ 3,52
Myo5bP21271 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
Myo5bP21271 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Myo5bP21271 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Myo5bP21271 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Myo5bP21271 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37,01■■■■□ 3,51
Myo5bP21271 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36,96■■■■□ 3,51
Myo5bP21271 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Myo5bP21271 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,51
Myo5bP21271 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Myo5bP21271 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Myo5bP21271 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36,86■■■■□ 3,49
Myo5bP21271 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Myo5bP21271 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36,82■■■■□ 3,48
Myo5bP21271 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
Myo5bP21271 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
Myo5bP21271 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36,73■■■■□ 3,47
Myo5bP21271 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,7■■■■□ 3,46
Myo5bP21271 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,69■■■■□ 3,46
Myo5bP21271 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36,68■■■■□ 3,46
Myo5bP21271 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Myo5bP21271 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36,67■■■■□ 3,46
Myo5bP21271 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36,58■■■■□ 3,45
Myo5bP21271 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36,55■■■■□ 3,44
Myo5bP21271 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Myo5bP21271 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Myo5bP21271 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36,4■■■■□ 3,42
Myo5bP21271 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,42
Myo5bP21271 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Myo5bP21271 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36,31■■■■□ 3,4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms