RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NischQ80TM9 1593 aa41.9■■■■■ 4.3
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc180J3QNE4 1664 aa38.27■■■■□ 3.72
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 ScribQ80U72 1612 aa36.93■■■■□ 3.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa36.75■■■■□ 3.47
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 HrcG5E8J6 738 aa36.32■■■■□ 3.4
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kdm5dQ62240 1548 aa36.28■■■■□ 3.4
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NacadQ5SWP3 1504 aa35.94■■■■□ 3.34
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sycp2Q9CUU3 1500 aa35.15■■■■□ 3.22
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pcgf6Q99NA9 353 aa34.45■■■■□ 3.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Golga3P55937 1487 aa34.43■■■■□ 3.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Chic1Q8CBW7 227 aa34.42■■■■□ 3.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cngb1E1AZ71 1325 aa34.4■■■■□ 3.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Synj1Q8CHC4 1574 aa34.38■■■■□ 3.09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 BicraF8VPZ9 1578 aa34.34■■■■□ 3.09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa34.31■■■■□ 3.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CftrP26361 1476 aa34.12■■■■□ 3.05
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gab3Q8BSM5 595 aa34.1■■■■□ 3.05
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Top2bQ64511 1612 aa34.1■■■■□ 3.05
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa34■■■■□ 3.03
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa33.7■■■□□ 2.99
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NefmP08553 848 aa33.68■■■□□ 2.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mier1Q5UAK0 511 aa33.6■■■□□ 2.97
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa33.51■■■□□ 2.96
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fmn1Q05860 1466 aa33.48■■■□□ 2.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sall2Q9QX96 1004 aa32.98■■■□□ 2.87
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Npm2Q80W85 207 aa32.7■■■□□ 2.83
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Clip1Q922J3 1391 aa32.67■■■□□ 2.82
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arhgap35Q91YM2 1499 aa32.56■■■□□ 2.8
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NrkQ9R0G8 1455 aa32.52■■■□□ 2.8
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lamc3Q9R0B6 1581 aa32.5■■■□□ 2.79
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wdr62Q3U3T8 1523 aa32.5■■■□□ 2.79
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Frmpd1A2AKB4 1549 aa32.49■■■□□ 2.79
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wdr66E9Q743 1299 aa32.46■■■□□ 2.79
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 ClspnQ80YR7 1315 aa32.46■■■□□ 2.79
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa32.43■■■□□ 2.78
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PtprkP35822 1457 aa32.42■■■□□ 2.78
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Anks4bQ8K3X6 423 aa32.42■■■□□ 2.78
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 TonslQ6NZL6 1363 aa32.37■■■□□ 2.77
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arap1Q4LDD4 1452 aa32.34■■■□□ 2.77
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Eea1Q8BL66 1411 aa32.32■■■□□ 2.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Shroom4Q1W617 1475 aa32.31■■■□□ 2.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Map3k1P53349 1493 aa32.3■■■□□ 2.76
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Unc13aQ4KUS2 1712 aa32.26■■■□□ 2.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc18Q640L5 1455 aa32.25■■■□□ 2.75
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tiam1Q60610 1591 aa32.07■■■□□ 2.72
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Erich3F6QRE9 1637 aa32.06■■■□□ 2.72
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Grin2bQ01097 1482 aa32.04■■■□□ 2.72
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Il27Q8K3I6 234 aa32■■■□□ 2.71
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa32■■■□□ 2.71
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ankrd26Q811D2 1581 aa31.95■■■□□ 2.7
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa31.91■■■□□ 2.7
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa31.91■■■□□ 2.7
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Naip1Q9QWK5 1403 aa31.88■■■□□ 2.69
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Csrnp3P59055 597 aa31.86■■■□□ 2.69
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