RNA–Protein interactions for RNA: YOL089C

HAL9, Transcript of Putative transcription factor containing a zinc finger, yeastyeast

Gene HAL9, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9YOL089C UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data2.65□□□□□ -1.99 RIP-Chip
HAL9YOL089C TPP1Q03796 238 aa2.65□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C MCM5P29496 775 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C ETP1P38748 585 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C NMD3P38861 518 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C BOL3P39724 118 aa2.65□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C MSH4P40965 878 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C GCV1P48015 400 aa2.65□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C MON1P53129 644 aa2.65□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C YNR063WP53749 607 aa2.65□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C NPR1P22211 790 aa2.64□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C AIM3P38266 947 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C QDR1P40475 563 aa2.64□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C OYE3P41816 400 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C UFD2P54860 961 aa2.64□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C MEC3Q02574 474 aa2.64□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C APC11Q12157 165 aa2.64□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C HTS1P07263 546 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C EAR1Q03212 550 aa2.63□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C YCR015CP25616 317 aa2.62□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C AIM26P32858 118 aa2.62□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C YVC1Q12324 675 aa2.62□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C YGR045CP53229 120 aa2.62□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C GRS1P38088 690 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C KTR2P33550 425 aa2.61□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C NNK1P36003 928 aa2.61□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C HSE1P38753 452 aa2.61□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C BSC2Q05611 235 aa2.61□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C PMT7Q06644 662 aa2.61□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C YIG1Q08956 461 aa2.61□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C SMY2P32909 740 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C TOD6P34219 525 aa2.6□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C SHU2P38957 223 aa2.6□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C MRPL22P53881 309 aa2.6□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C CMR1Q12510 522 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C INP54Q08227 384 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C TAF1P46677 1066 aa2.6□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C MTR4P47047 1073 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C ALT1P52893 592 aa2.6□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C PEX13P80667 386 aa2.6□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C CDA2Q06703 312 aa2.6□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C HVG1P0CE11 249 aa2.59□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C YHL012WP38709 493 aa2.59□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C RSM26P47141 266 aa2.59□□□□□ -1.99
HAL9YOL089C YAR028WP39548 234 aa2.59□□□□□ -2
HAL9YOL089C YNL011CP53980 444 aa2.59□□□□□ -2
HAL9YOL089C PUS7Q08647 676 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
HAL9YOL089C CTR9P89105 1077 aa2.58□□□□□ -2
HAL9YOL089C YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
HAL9YOL089C LAP2Q10740 671 aa2.58□□□□□ -2
HAL9YOL089C RET1P22276 1149 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
HAL9YOL089C SQT1P35184 431 aa2.58□□□□□ -2
HAL9YOL089C YAF9P53930 226 aa2.58□□□□□ -2
HAL9YOL089C NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
HAL9YOL089C RIM8P53179 542 aa2.57□□□□□ -2
HAL9YOL089C SUB2Q07478 446 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
HAL9YOL089C RSB1Q08417 382 aa2.57□□□□□ -2
HAL9YOL089C PEX7P39108 375 aa2.57□□□□□ -2
HAL9YOL089C SLS1P42900 643 aa2.57□□□□□ -2
HAL9YOL089C SPT20P50875 604 aa2.57□□□□□ -2
HAL9YOL089C HRK1Q08732 759 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
HAL9YOL089C COBP00163 385 aa2.57□□□□□ -2
HAL9YOL089C DUR3P33413 735 aa2.57□□□□□ -2
HAL9YOL089C TRS120Q04183 1289 aa2.57□□□□□ -2
HAL9YOL089C NBA1Q08229 501 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
HAL9YOL089C FLR1P38124 548 aa2.56□□□□□ -2
HAL9YOL089C RIM11P38615 370 aa2.56□□□□□ -2
HAL9YOL089C NUT1P53114 1132 aa2.56□□□□□ -2
HAL9YOL089C SNO2P53823 222 aa2.56□□□□□ -2
HAL9YOL089C LPX1Q12405 387 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
HAL9YOL089C FLP1P03870 423 aa2.56□□□□□ -2
HAL9YOL089C RPS13P05756 151 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
HAL9YOL089C RVS167P39743 482 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
HAL9YOL089C RSC4Q02206 625 aa2.56□□□□□ -2
HAL9YOL089C TUB2P02557 457 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
HAL9YOL089C TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
HAL9YOL089C TY1A-DR6P0CX70 440 aa2.55□□□□□ -2
HAL9YOL089C TY1A-ER1P0CX71 440 aa2.55□□□□□ -2
HAL9YOL089C TY1A-LR2P0CX72 440 aa2.55□□□□□ -2
HAL9YOL089C TY1A-PLP0CX73 440 aa2.55□□□□□ -2
HAL9YOL089C TY1A-JR1P0CX74 440 aa2.55□□□□□ -2
HAL9YOL089C TY1A-LR3P0CX75 440 aa2.55□□□□□ -2
HAL9YOL089C TY1A-ML2P0CX76 440 aa2.55□□□□□ -2
HAL9YOL089C YPL277CQ08989 487 aa2.55□□□□□ -2
HAL9YOL089C TY1A-GR1Q12085 440 aa2.55□□□□□ -2
HAL9YOL089C TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
HAL9YOL089C TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
HAL9YOL089C DED1P06634 604 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
HAL9YOL089C PRP6P19735 899 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
HAL9YOL089C CIC1P38779 376 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
HAL9YOL089C XKS1P42826 600 aa2.55□□□□□ -2
HAL9YOL089C SAM37P50110 327 aa2.55□□□□□ -2
HAL9YOL089C ATG1P53104 897 aa2.55□□□□□ -2
HAL9YOL089C SPS1P08458 490 aa2.54□□□□□ -2
HAL9YOL089C CDC55Q00362 526 aa2.54□□□□□ -2
HAL9YOL089C MDL2P33311 773 aa2.54□□□□□ -2
HAL9YOL089C ACF4P47129 309 aa2.54□□□□□ -2
HAL9YOL089C YDL177CQ12257 170 aa2.54□□□□□ -2
HAL9YOL089C SHM2P37291 469 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
HAL9YOL089C THI12P42883 340 aa2.53□□□□□ -2
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