RNA–Protein interactions for RNA: YMR115W

MGR3, Transcript of Subunit of the mitochondrial (mt) i-AAA protease supercomplex, yeast

Gene MGR3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MGR3	YMR115W	YGR130C	P53278	816 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	MEC3	Q02574	474 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	YCS4	Q06156	1176 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	GIC2	Q06648	383 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	MET4	P32389	672 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	VPS35	P34110	944 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	GPT2	P36148	743 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	SPO74	P45819	413 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	WHI5	Q12416	295 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MGR3	YMR115W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	TOS1	P38288	455 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	THI12	P42883	340 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	THI5	P43534	340 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	THI11	P47183	340 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	THI13	Q07748	340 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	CYC7	P00045	113 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	SEC20	P28791	383 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	YKL077W	P36081	392 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	EXO5	P38289	585 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	IPL1	P38991	367 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	DAK2	P43550	591 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.23	□□□□□ -1.25	not detected
MGR3	YMR115W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	SHU2	P38957	223 aa		7.23	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	MMM1	P41800	426 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	CTH1	P47976	325 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	DAL4	Q04895	635 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	UGA4	P32837	571 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	LIP5	P32875	414 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	SLS1	P42900	643 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	TOS4	Q06266	489 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	BRE4	Q07660	1125 aa		7.22	□□□□□ -1.25
MGR3	YMR115W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	YGR045C	P53229	120 aa		7.21	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	NEM1	P38757	446 aa		7.2	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	OXR1	Q08952	273 aa		7.2	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	CIT3	P43635	486 aa		7.19	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	ULP1	Q02724	621 aa		7.19	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	AVO1	Q08236	1176 aa		7.19	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	MSH3	P25336	1018 aa		7.17	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	SLD2	P34252	453 aa		7.17	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	ALT1	P52893	592 aa		7.17	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	PEX13	P80667	386 aa		7.17	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	RSM26	P47141	266 aa		7.17	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	RCM1	P53972	490 aa		7.16	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	SDH1	Q00711	640 aa		7.16	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	EAR1	Q03212	550 aa		7.16	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
MGR3	YMR115W	NFS1	P25374	497 aa		7.15	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	SQT1	P35184	431 aa		7.15	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	FAA3	P39002	694 aa		7.15	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	YPL109C	Q02981	657 aa		7.15	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	YML020W	Q03722	664 aa		7.15	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	NNK1	P36003	928 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	SEA4	P38164	1038 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	PEX28	P38848	579 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	ADI1	Q03677	179 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	NSI1	Q12457	570 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	YAR028W	P39548	234 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	XKS1	P42826	600 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	YGL140C	P53120	1219 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	YVC1	Q12324	675 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	RDH54	P38086	958 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MGR3	YMR115W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.08	□□□□□ -1.28	not detected
MGR3	YMR115W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
MGR3	YMR115W	PIC2	P40035	300 aa		7.08	□□□□□ -1.28

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