RNA–Protein interactions for RNA: YKR065C

PAM17, Transcript of Constituent of the TIM23 complex, yeast

Gene PAM17, Length 594 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM17	YKR065C	SMC1	P32908	1225 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PAM17	YKR065C	KAR5	Q04746	504 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PAM17	YKR065C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
PAM17	YKR065C	AIM46	P38885	310 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PAM17	YKR065C	RGD2	P43556	714 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PAM17	YKR065C	PPT1	P53043	513 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PAM17	YKR065C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
PAM17	YKR065C	YAP3	P38749	330 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PAM17	YKR065C	SSM4	P40318	1319 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PAM17	YKR065C	GEF1	P37020	779 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PAM17	YKR065C	RAD55	P38953	406 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PAM17	YKR065C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PAM17	YKR065C	TAT1	P38085	619 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PAM17	YKR065C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PAM17	YKR065C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PAM17	YKR065C	ATG1	P53104	897 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PAM17	YKR065C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
PAM17	YKR065C	YJL181W	P46987	611 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PAM17	YKR065C	BUD9	P53226	547 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PAM17	YKR065C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PAM17	YKR065C	PSY2	P40164	858 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PAM17	YKR065C	QDR1	P40475	563 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PAM17	YKR065C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
PAM17	YKR065C	PRY1	P47032	299 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PAM17	YKR065C	UFD2	P54860	961 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PAM17	YKR065C	RRM3	P38766	723 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PAM17	YKR065C	ACF4	P47129	309 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PAM17	YKR065C	FUS1	P11710	512 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PAM17	YKR065C	GIP2	P40036	548 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PAM17	YKR065C	AI3	P03877	415 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PAM17	YKR065C	IPL1	P38991	367 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PAM17	YKR065C	LEM3	P42838	414 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PAM17	YKR065C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PAM17	YKR065C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PAM17	YKR065C	YOR093C	Q12275	1648 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PAM17	YKR065C	SFA1	P32771	386 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PAM17	YKR065C	GUP1	P53154	560 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PAM17	YKR065C	ALD3	P54114	506 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PAM17	YKR065C	SOG2	Q08817	791 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PAM17	YKR065C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PAM17	YKR065C	MCA1	Q08601	432 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PAM17	YKR065C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PAM17	YKR065C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PAM17	YKR065C	PAF1	P38351	445 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PAM17	YKR065C	TED1	P40533	473 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PAM17	YKR065C	LSB6	P42951	607 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PAM17	YKR065C	SAC7	P17121	654 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PAM17	YKR065C	HAP1	P0CE41	1502 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PAM17	YKR065C	GCN2	P15442	1659 aa		10.15	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	TFA2	P36145	328 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	DSE4	P53753	1117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	RSC4	Q02206	625 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	TRS120	Q04183	1289 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	YPL034W	Q03083	165 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	GAS5	Q08193	484 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	MAK10	Q02197	733 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	DNF3	Q12674	1656 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	PAN5	P38787	379 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	ERP5	P38819	212 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	HAT1	Q12341	374 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	GLO4	Q12320	285 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PAM17	YKR065C	HVG1	P0CE11	249 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PAM17	YKR065C	RSC6	P25632	483 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PAM17	YKR065C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PAM17	YKR065C	YNL011C	P53980	444 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PAM17	YKR065C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PAM17	YKR065C	MDJ2	P42834	146 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PAM17	YKR065C	YJR124C	P47159	448 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PAM17	YKR065C	SPO71	Q03868	1245 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PAM17	YKR065C	IML1	P47170	1584 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PAM17	YKR065C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PAM17	YKR065C	YNR065C	P53751	1116 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PAM17	YKR065C	CTR9	P89105	1077 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PAM17	YKR065C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PAM17	YKR065C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PAM17	YKR065C	CDC55	Q00362	526 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PAM17	YKR065C	MNL2	Q12205	849 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PAM17	YKR065C	NEO1	P40527	1151 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PAM17	YKR065C	FET4	P40988	552 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PAM17	YKR065C	BSC2	Q05611	235 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PAM17	YKR065C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PAM17	YKR065C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PAM17	YKR065C	RAV1	P47104	1357 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PAM17	YKR065C	VMR1	P38735	1592 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PAM17	YKR065C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PAM17	YKR065C	ELG1	Q12050	791 aa		10	□□□□□ -0.81
PAM17	YKR065C	COB	P00163	385 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PAM17	YKR065C	MSH6	Q03834	1242 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PAM17	YKR065C	NUT2	Q06213	157 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PAM17	YKR065C	FRT1	Q99332	602 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PAM17	YKR065C	RTC1	Q08281	1341 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PAM17	YKR065C	COQ2	P32378	372 aa		9.98	□□□□□ -0.81

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