RNA–Protein interactions for RNA: YHL030W

ECM29, Transcript of Scaffold protein, yeast

Gene ECM29, Length 5,607 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM29	YHL030W	MAL33	P38157	468 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	INA22	P40576	216 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	COG4	Q06096	861 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	AFT2	Q08957	416 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	GDB1	Q06625	1536 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.99	□□□□□ -1.93	not detected
ECM29	YHL030W	WAR1	Q03631	944 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	ATG17	Q06410	417 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	LYS2	P07702	1392 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	BUD3	P25558	1636 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SMI1	P32566	505 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	YPT11	P48559	417 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	STE23	Q06010	1027 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	RKM4	Q12504	494 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	NPL6	P32832	435 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	TFC3	P34111	1160 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	YEL1	P34225	687 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	PEX5	P35056	612 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	COG6	P53959	839 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	ZDS2	P54786	942 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	TAH18	Q12181	623 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	YSP2	Q06681	1438 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	ATG19	P35193	415 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	YFL034W	P43564	1073 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	YPL260W	Q08977	551 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	OPI1	P21957	404 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	ELM1	P32801	640 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	LAM1	P38851	1228 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	DSL1	P53847	754 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	GIS4	Q04233	774 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SML1	Q04964	104 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.98	□□□□□ -1.93	RIP-Chip
ECM29	YHL030W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	PSO2	P30620	661 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	VPS35	P34110	944 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	RCR1	P38212	213 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SEC39	Q12745	709 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	YRF1-4	O13559	1382 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	VPS45	P38932	577 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	RGD2	P43556	714 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	ENT2	Q05785	613 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	FBP26	P32604	452 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	REV7	P38927	245 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	YTA6	P40328	754 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	PXA1	P41909	870 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	ALD2	P47771	506 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	YNL193W	P53870	558 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	ALD3	P54114	506 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	PDR11	P40550	1411 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	ATG2	P53855	1592 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	RAM2	P29703	316 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SSP1	P38871	571 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	AKR1	P39010	764 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	VID27	P40157	782 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	ERP6	P53198	216 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	BET4	Q00618	327 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	ADY3	Q07732	790 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SLM3	Q12093	417 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	GYP5	Q12344	894 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	IES2	P40154	320 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	TAF1	P46677	1066 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	DSE4	P53753	1117 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	PSF3	Q12146	194 aa		2.97	□□□□□ -1.93

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.2 ms