RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W ATG1P53104 897 aa5.84□□□□□ -1.47
NSE4YDL105W CTR9P89105 1077 aa5.84□□□□□ -1.47
NSE4YDL105W HTS1P07263 546 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W ACF4P47129 309 aa5.83□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W MEC3Q02574 474 aa5.83□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W NPR1P22211 790 aa5.82□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W SSA1P10591 642 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W RIM11P38615 370 aa5.81□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W MSH4P40965 878 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W ALT1P52893 592 aa5.81□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W TRE1Q08919 783 aa5.81□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W PRP5P21372 849 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W GIP4P39732 760 aa5.8□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W YNL011CP53980 444 aa5.8□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W TRS120Q04183 1289 aa5.8□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W CMR1Q12510 522 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W THI80P35202 319 aa5.79□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W REI1P38344 393 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W TAF1P46677 1066 aa5.79□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W SSY1Q03770 852 aa5.79□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W COBP00163 385 aa5.78□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W PRP6P19735 899 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W MSH6Q03834 1242 aa5.78□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W BSC2Q05611 235 aa5.78□□□□□ -1.48
NSE4YDL105W YVC1Q12324 675 aa5.77□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W CDC3P32457 520 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W PEX7P39108 375 aa5.76□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W CDC55Q00362 526 aa5.76□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W TRL1P09880 827 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W NFS1P25374 497 aa5.75□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W PRO1P32264 428 aa5.75□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W SMY2P32909 740 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W NNK1P36003 928 aa5.75□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W EAR1Q03212 550 aa5.75□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W MNL2Q12205 849 aa5.75□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W LPX1Q12405 387 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W FLP1P03870 423 aa5.74□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W DUR3P33413 735 aa5.74□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W ARL1P38116 183 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W SAP155P43612 1002 aa5.73□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W HDA2Q06629 674 aa5.73□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W PMT7Q06644 662 aa5.73□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W GRS1P38088 690 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W FLR1P38124 548 aa5.72□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W AVO1Q08236 1176 aa5.72□□□□□ -1.49
NSE4YDL105W PTC7P38797 343 aa5.71□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W NUT1P53114 1132 aa5.71□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W YGR045CP53229 120 aa5.71□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W ELA1P53861 379 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W MRPL22P53881 309 aa5.71□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W GEF1P37020 779 aa5.7□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W MDJ2P42834 146 aa5.7□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W RIM8P53179 542 aa5.7□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W YAF9P53930 226 aa5.7□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W YBL113CQ7M4S9 792 aa5.7□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W AIM3P38266 947 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W ERP5P38819 212 aa5.69□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W RVS167P39743 482 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W INP54Q08227 384 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W MCM5P29496 775 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W GTS1P40956 396 aa5.68□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W SAM37P50110 327 aa5.68□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W HAT1Q12341 374 aa5.67□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W YKL077WP36081 392 aa5.66□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W SHU2P38957 223 aa5.66□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W NUT2Q06213 157 aa5.66□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W YDL177CQ12257 170 aa5.66□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W FRT1Q99332 602 aa5.66□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W SOD2P00447 233 aa5.65□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W TY1A-DR6P0CX70 440 aa5.65□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W TY1A-ER1P0CX71 440 aa5.65□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W TY1A-LR2P0CX72 440 aa5.65□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W TY1A-PLP0CX73 440 aa5.65□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W TY1A-JR1P0CX74 440 aa5.65□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W TY1A-LR3P0CX75 440 aa5.65□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W TY1A-ML2P0CX76 440 aa5.65□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W CIC1P38779 376 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W MON1P53129 644 aa5.65□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W GIS1Q03833 894 aa5.65□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W GSF2Q04697 403 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W GPI13Q07830 1017 aa5.65□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W TY1A-GR1Q12085 440 aa5.65□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
NSE4YDL105W FOL2P51601 243 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
NSE4YDL105W TPP1Q03796 238 aa5.64□□□□□ -1.51
NSE4YDL105W YCS4Q06156 1176 aa5.63□□□□□ -1.51
NSE4YDL105W ETP1P38748 585 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
NSE4YDL105W SNO2P53823 222 aa5.62□□□□□ -1.51
NSE4YDL105W TOD6P34219 525 aa5.61□□□□□ -1.51
NSE4YDL105W EXO5P38289 585 aa5.61□□□□□ -1.51
NSE4YDL105W YHL012WP38709 493 aa5.61□□□□□ -1.51
NSE4YDL105W RPS13P05756 151 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
NSE4YDL105W MDL2P33311 773 aa5.6□□□□□ -1.51
NSE4YDL105W YAR028WP39548 234 aa5.6□□□□□ -1.51
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