RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019577.9

Gipc1-201, Transcript of PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gipc1, Length 1,522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Apaf1O88879 1249 aa30,18■■■□□ 2,42
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Qtrt2B8ZXI1 415 aa30,16■■■□□ 2,42
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Eya1P97767 591 aa30,15■■■□□ 2,42
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP30,15■■■□□ 2,42
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP30,15■■■□□ 2,42
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 HypkQ9CR41 129 aa29,99■■■□□ 2,39
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ccdc30Q8BVF4 654 aa29,98■■■□□ 2,39
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Col15a1O35206 1367 aa29,98■■■□□ 2,39
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Rtl5Q5DTT4 599 aa29,96■■■□□ 2,39
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Simc1E9Q6E9 1354 aa29,96■■■□□ 2,39
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ecm2Q5FW85 670 aa29,94■■■□□ 2,38
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Amotl1Q9D4H4 968 aa29,88■■■□□ 2,37
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Aplp2Q06335 707 aa29,87■■■□□ 2,37
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Zranb3Q6NZP1 1069 aa29,87■■■□□ 2,37
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ggt6Q6PDE7 497 aa29,87■■■□□ 2,37
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Zeb2Q9R0G7 1215 aa29,86■■■□□ 2,37
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 ThemisQ8BGW0 636 aa29,8■■■□□ 2,36
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Gas2l2Q5SSG4 860 aa29,71■■■□□ 2,35
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP29,71■■■□□ 2,35
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa29,71■■■□□ 2,35
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Aox2Q5SGK3 1345 aa29,7■■■□□ 2,35
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Sos1Q62245 1319 aa29,7■■■□□ 2,35
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Cntnap1O54991 1385 aa29,69■■■□□ 2,34
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Abcc12Q80WJ6 1366 aa29,69■■■□□ 2,34
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Sema6bO54951 886 aa29,69■■■□□ 2,34
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